羅氏454和Integrated DNA技術(shù)公司就引物設(shè)計和供應(yīng)達成全球獨家協(xié)議
瀏覽次數(shù):5034 發(fā)布日期:2008-12-30
來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處
454 生命科學(xué)( 羅氏子公司) 和美國集成DNA 技術(shù)公司( Integrated DNATechnologies, Inc.)今天宣布,他們已經(jīng)達成了一項獨家的共同促銷協(xié)議,其中IDT負責(zé)設(shè)計、合成并純化454測序應(yīng)用中必需的融合引物。這些應(yīng)用包括用于檢測疾病相關(guān)基因的低頻率突變的超深度擴增子測序,和群體中常見的和稀有變異體的綜合鑒定和定量。這次的合作為Genome Sequencer FLX的用戶提供了引物合成的便利方案,簡化了工作流程,減輕了用戶在生物信息學(xué)方面的負擔(dān)。
IDT簡明易用的在線融合引物設(shè)計工具可利用提供的對照序列來構(gòu)建針對目標(biāo)DNA區(qū)域的相應(yīng)的454融合引物。這些DNA區(qū)域可包括單個外顯子或一個甚至多個基因的所有外顯子。DNA二級結(jié)構(gòu),如發(fā)夾結(jié)構(gòu),可能會影響引物的性能。這個軟件考慮了整個融合引物的性能,而不是簡單地在其他標(biāo)準(zhǔn)PCR引物上加個454的通用接頭。除了454FusionPrimer設(shè)計,IDT在高保真合成和HPLC純化上也很有經(jīng)驗,有助于研究人員獲得
454測序的最高品質(zhì)數(shù)據(jù)。
“我們很高興利用了IDT在引物設(shè)計和合成上的豐富經(jīng)驗,來為我們的客戶提供了目標(biāo)重測序計劃的一站式解決方案。”454生命科學(xué)的CEO Chris McLeod表示,“把引物設(shè)計的任務(wù)交給IDT的在線工具來完成,研究人員現(xiàn)在能集中更多精力來實現(xiàn)探索!
作為唯一能實現(xiàn)序列讀長超過400 bp的新一代測序技術(shù),Genome Sequencer FLX系統(tǒng)可實現(xiàn)包括全部外顯子和其他基因組區(qū)域的單體型分析在內(nèi)的綜合分析。該系統(tǒng)高度精確、超長序列讀長促使一系列強大應(yīng)用成為可能,新的引物設(shè)計工具進一步簡化了這些工作。其中包括檢測癌癥樣品中低頻率體細胞突變的超深度測序,HIV感染個體的稀有變異探索,疾病相關(guān)區(qū)域外顯子序列分析,通過全基因組聯(lián)合分析和對16S核糖體RNA區(qū)域的鑒定來描繪出宏基因組樣品中的微生物豐度和多樣性。
454 生命科學(xué)是羅氏應(yīng)用科學(xué)旗下卓越的中心之一,開發(fā)并商業(yè)化了創(chuàng)新的454 測序系統(tǒng),用于超高通量的DNA 測序。具體的應(yīng)用包括基因組的從頭測序和重測序、宏基因組學(xué)、RNA 分析和DNA 目標(biāo)區(qū)域的定向測序。454 測序系統(tǒng)的特點是樣品制備簡單且無偏向性,讀長包括配對末端讀長超長且準(zhǔn)確度高。454 測序系統(tǒng)的技術(shù)已經(jīng)催生了各個研究領(lǐng)域的幾百項經(jīng)同行評議的研究,例如癌癥和傳染病研究、藥物篩選、海洋生物學(xué)、人類學(xué)、古生物學(xué)等多個方面。更多信息,請查看http:///。