安捷倫推出定制靶向序列捕獲試劑盒,序列范圍擴(kuò)展5倍
瀏覽次數(shù):3033 發(fā)布日期:2011-5-20
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安捷倫科技針對(duì)新一代測(cè)序的定制靶向序列捕獲試劑盒序列范圍擴(kuò)展 5 倍,堿基覆蓋可高達(dá) 34 Mb
2011 年 4 月,北京 -- 安捷倫科技公司(紐約證交所:A)今日宣布推出用于新一代測(cè)序(NGS) SureSelect XT 靶向序列捕獲系統(tǒng)的最新定制試劑盒,該試劑盒可捕獲高達(dá) 34 Mb 的目標(biāo)基因組區(qū)域。
新版定制試劑盒的序列覆蓋范圍比舊版擴(kuò)展了 5 倍,這使得研究人員能夠?qū)⒀芯糠秶鷱娜祟愅怙@子擴(kuò)展到對(duì)動(dòng)物、微生物、植物及其它生物體中較大的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,目前尚沒(méi)有針對(duì)此類研究的商業(yè)化預(yù)定義或目錄版的靶向序列捕獲試劑盒。
現(xiàn)在研究人員可以利用目錄試劑盒或定制試劑盒對(duì)高達(dá) 34 Mb 的序列進(jìn)行研究,這種撒大網(wǎng)的方式有利于發(fā)現(xiàn) SNP、插入/缺失以及拷貝數(shù)變異。然后他們可以設(shè)計(jì)有針對(duì)性的自定義序列捕獲文庫(kù),用于后續(xù)的大量樣品研究。安捷倫提供 eArray 在線靶向序列捕獲和芯片設(shè)計(jì)工具,可幫助用戶設(shè)計(jì)并訂購(gòu) SureSelect XT 定制版靶向序列捕獲試劑盒(可選 10 到 5000 次反應(yīng),及適用于各種主流 NGS 平臺(tái)的格式)。
安捷倫 SureSelect 平臺(tái)市場(chǎng)總監(jiān) Fred P. Ernani 博士說(shuō):“安捷倫在定制長(zhǎng)鏈寡核苷酸制造方面的出眾能力再加上 eArray 設(shè)計(jì)工具的強(qiáng)大功能,能夠?yàn)檠芯咳藛T帶來(lái)卓越的具有高度靈活性且可定制的 NGS 靶向序列捕獲系統(tǒng),F(xiàn)在,安捷倫能夠?yàn)檠芯咳藛T提供 200 Kb 到 34 Mb 的大范圍定制捕獲試劑盒,幾乎適用于任何規(guī)模的研究!
隨著測(cè)序結(jié)果的不斷產(chǎn)生,研究人員可以不斷采用 SureSelect 和 eArray 工具反復(fù)進(jìn)行快速設(shè)計(jì)和完善。現(xiàn)在,SureSelect XT 用戶擁有全面的文庫(kù)設(shè)計(jì)選擇,從可直接使用的目錄版試劑盒到結(jié)合了目錄版和定制版內(nèi)容的復(fù)合設(shè)計(jì)試劑盒,再到完全定制設(shè)計(jì)的試劑盒。
擁有DNA 靶向序列捕獲和 RNA 靶向序列捕獲的 SureSelect XT 產(chǎn)品線成為應(yīng)用范圍最廣的新一代靶向測(cè)序技術(shù)平臺(tái)。定制試劑盒的不斷發(fā)展使得早期使用的客戶能夠捕獲超過(guò) 60 Mb 的序列。
靶向序列捕獲工作流程
靶向序列捕獲使研究人員可以僅對(duì)目標(biāo)基因組區(qū)域(而非整個(gè)基因組)進(jìn)行測(cè)序,從而簡(jiǎn)化NGS工作流程。結(jié)合領(lǐng)先的新一代測(cè)序系統(tǒng)的更高速度,SureSelect XT 的多重檢測(cè)支持功能使得研究人員在每次實(shí)驗(yàn)中都能更全面地認(rèn)識(shí)更多樣品的基因組,這在過(guò)去是難以實(shí)現(xiàn)的。文庫(kù)制備和靶向序列捕獲流程的瓶頸已經(jīng)得到有效解決。
為進(jìn)一步提高處理通量,安捷倫還提供了集成式工作站,用于自動(dòng)化完成 SureSelect XT 文庫(kù)制備和靶向序列捕獲工作流程?舍槍(duì)多重測(cè)序?qū)悠愤M(jìn)行索引,且所有試劑都適合自動(dòng)化操作。不久之后,安捷倫的 Bravo 自動(dòng)化液體處理系統(tǒng)所支持的自動(dòng)化方案將增加 RNA 捕獲自動(dòng)化統(tǒng)包方案。
SureSelect 靶向序列捕獲平臺(tái)作為基因發(fā)現(xiàn)的核心工具,現(xiàn)已被 50 多篇同行評(píng)審的論文所引用!犊茖W(xué)》雜志 12 月 17 日刊登的 2010 年十大科學(xué)突破中,其中兩項(xiàng)突破“Reading the Neandertal Genome”(解讀尼安德特人基因組)和“Homing In on Errant Genes”(外顯子組測(cè)序/罕見(jiàn)疾病基因)均采用了本系統(tǒng)。
關(guān)于安捷倫科技
安捷倫科技公司(紐約證交所:A)是全球領(lǐng)先的測(cè)量公司,同時(shí)也是通信、電子、生命科學(xué)和化學(xué)分析領(lǐng)域的技術(shù)領(lǐng)導(dǎo)者。公司的 18500 名員工為 100 多個(gè)國(guó)家的客戶提供服務(wù)。在 2010 財(cái)政年度,安捷倫的業(yè)務(wù)凈收入為 54 億美元。要了解安捷倫科技的信息,請(qǐng)?jiān)L問(wèn):www.agilent.com.cn。