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采用Arraystar lncRNA芯片發(fā)現(xiàn)病毒型肝癌的新靶點(diǎn)

瀏覽次數(shù):3944 發(fā)布日期:2011-8-3  來(lái)源:上?党缮
    第二軍醫(yī)大學(xué)孫樹(shù)漢教授課題組長(zhǎng)期致力于肝癌研究,許多實(shí)驗(yàn)成果已經(jīng)發(fā)表在國(guó)際頂級(jí)期刊上。此次研究利用Arraystar lncRNA芯片(長(zhǎng)鏈非編碼RNA芯片)對(duì)肝癌及癌旁組織進(jìn)行系統(tǒng)性篩查,發(fā)現(xiàn)lncRNA-HEIH在乙型肝炎病毒(HBV)導(dǎo)致的肝癌(HCC)發(fā)生中起重要作用,研究成果發(fā)表在Hepatology。
 
    此次研究中l(wèi)ncRNA芯片實(shí)驗(yàn)在康成生物公司完成。
 
Yang, F., et al.,  Long non-coding RNA high expressed in hepatocellular carcinoma (lncRNA-HEIH) facilitates tumor growth through enhancer of zeste homolog 2.  Hepatology,  2011.    (影響因子:10.885)
 
    文章首先通過(guò)Arraystar公司的LncRNA芯片對(duì)HBV導(dǎo)致的肝癌組織(n=5)及癌旁組織(n=5)中的長(zhǎng)鏈非編碼RNA進(jìn)行了系統(tǒng)的檢測(cè)與比較,并且通過(guò)50對(duì)標(biāo)本的進(jìn)一步qPCR驗(yàn)證,找到了一組癌與癌旁中差異表達(dá)的lncRNA。實(shí)驗(yàn)者特別關(guān)注一個(gè)在癌組織中特異性高表達(dá)的新LncRNA(lncRNA-HEIH:lncRNA High Expression in HCC)。
 
    實(shí)驗(yàn)者進(jìn)一步研究lncRNA-HEIH與肝癌之間的功能聯(lián)系。通過(guò)與病人生存時(shí)間等臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)lncRNA-HEIH的表達(dá)水平可以作為病人生存時(shí)間的預(yù)測(cè)標(biāo)志,并且和癌癥的復(fù)發(fā)有很強(qiáng)的相關(guān)性。對(duì)lncRNA-HEIH的功能研究發(fā)現(xiàn)它在細(xì)胞周期調(diào)控中起重要作用,它可能通過(guò)與EZH2結(jié)合來(lái)募集PRC2,進(jìn)而抑制下游靶基因的表達(dá)從而發(fā)揮其調(diào)控功能。這些結(jié)果表明lncRNA-HEIH有望成為病毒型肝癌的一個(gè)新的早期診斷標(biāo)志或治療靶點(diǎn)。
 
圖示:肝癌(n=5)和癌旁組織(n=5)的芯片聚類(lèi)結(jié)果。Arraystar公司的lncRNA芯片同時(shí)設(shè)計(jì)了mRNA與lncRNA,圖A為差異表達(dá)的254個(gè)mRNA聚類(lèi)結(jié)果,圖B為差異表達(dá)的174個(gè)lncRNA聚類(lèi)結(jié)果。紅色代表上調(diào),綠色代表下調(diào)。


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