第一天 9:00-17:00 主題:小分子藥物設(shè)計
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08:00 - 08:50
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簽到 | 安裝軟件
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08:50 - 09:00
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主辦方致辭
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09:00 - 10:15
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MOE基礎(chǔ)介紹
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A.MOE窗口介紹;
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B.利用MOE獲得和保存數(shù)據(jù);
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C.MOE數(shù)據(jù)庫介紹和化學(xué)信息學(xué);
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D.小分子化合物的構(gòu)象搜索;
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10:15 - 10:30
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茶歇 | 交流
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10:30 - 12:00
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藥物設(shè)計中的藥效團(tuán)建模
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A.在MOE中構(gòu)建藥效團(tuán)模型;
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B.在藥物設(shè)計中使用藥效團(tuán);
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12:00 - 13:30
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午餐 | 休息| 海報交流
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13:30 - 14:15
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蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)處理
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A.蛋白結(jié)晶結(jié)構(gòu)修正、質(zhì)子化;
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B.結(jié)晶水處理;
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14:15 - 15:15
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基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計
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A.分子對接;
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B.抗糖尿病藥物阿格列汀的全新藥物設(shè)計;
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15:15 - 15:30
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茶歇 | 交流
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15:30 - 16:00
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激酶應(yīng)用
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16:00 - 17:00
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基于片段的藥物設(shè)計
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A.骨架替換;
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B.片段連接;
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C.片段生長;
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D.BREED;
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17:00 - 17:30
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AutoGPA----MOE中的3D QSAR
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第二天 9:00-17:00 主題:蛋白建模及生物藥設(shè)計
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9:00 - 10:15
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蛋白比對、疊合及相似結(jié)構(gòu)搜索
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A.處理PDB文件;
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B.處理蛋白構(gòu)象;
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C.基于保守區(qū)域的蛋白疊合;
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D.基于結(jié)合口袋疊合蛋白;
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E.基于配體疊合蛋白;
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F.蛋白相似結(jié)構(gòu)域搜索;
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10:15 - 10:30
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茶歇 | 交流
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10:30 - 12:00
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蛋白同源建模
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A.普通同源建模
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B.GPCR建模
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12:00 - 13:30
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午餐 | 休息 | 海報交流
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13:30 - 15:15
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抗體建模及設(shè)計
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A.抗體結(jié)構(gòu)概覽
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B.抗體建模
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C.互補(bǔ)決定區(qū)Loop構(gòu)象采樣
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D.經(jīng)典保守殘基分析
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15:15 - 15:30
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茶歇 | 休息
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15:30 - 17:00
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蛋白設(shè)計
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A.丙氨酸掃描
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B.二硫鍵掃描
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C.抗藥性突變掃描
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D.序列設(shè)計
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E.蛋白沉聚性質(zhì)分析
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F.蛋白屬性計算
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第三天 9:00 - 17:00 定制開發(fā)、批量流程化及動力學(xué)模擬
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9:00 - 10:45
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SVL語言及開發(fā)范例介紹
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10:45 - 11:00
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茶歇 | 交流
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11:00 - 12:00
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SVL語言及開發(fā)范例介紹
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12:00 - 13:30
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午餐 | 休息 | 海報交流
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13:30 - 15:00
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MOE在KNIME環(huán)境下的工作流構(gòu)建
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15:00 - 15:15
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茶歇 | 休息
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15:15 - 17:00
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動力學(xué)模擬
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