2014屆生物信息學暑期研習班邀請函
2014年7月22-26日,上海海荷歐風酒店
尊敬的老師:
您好!
上海生咨生物科技有限公司盛情邀請您參加2014屆生物信息學暑期研習班。本次研習班將在2014年7月22日至7月26日在上海舉辦。
本次研習班從基因組學(基因組高通量測序數(shù)據(jù)分析),轉(zhuǎn)錄組(RNAseq數(shù)據(jù)分析、miRNA數(shù)據(jù)分析、表達譜芯片分析)、蛋白質(zhì)組(iTRAQ數(shù)據(jù)分析)、進化分析等多個方面講解各種組學數(shù)據(jù)的分析方法。研習班將由多年從事生物信息學分析研究的科研專家和技術(shù)工程師共同授課,通過深入淺出的理論講解和上機操作,幫助學員深入了解從基因組-轉(zhuǎn)錄組-蛋白質(zhì)組的研究思路和數(shù)據(jù)分析方法,幫助學員拓展研究思路,掌握一些數(shù)據(jù)分析的方法。
本次研習班適合:
1、零生物信息學知識但想要了解生物信息學的學員;
2、正在或者將進行組學研究的科研人員;
3、已有組學數(shù)據(jù)需了解分析方法的研究人員;
4、想要將來從事生物信息學方向工作的學生或者工作人員。
主辦單位:上海生咨生物科技有限公司
協(xié)辦單位:上海產(chǎn)業(yè)技術(shù)研究院藥物轉(zhuǎn)化創(chuàng)新中心
支持單位:杭州谷禾信息技術(shù)有限公司
時間:2014年7月22日-2014年7月26日
地點:海荷歐風酒店,上海市閘北區(qū)共和新路1301號
課程安排:2014年7月22日-7月26日,報到時間2014年7月21日下午14:30- 17:30。
|
時間 |
課程內(nèi)容 |
注冊 |
7月21日 12:30 - 17:30
7月22日 8:30 - 9:30 |
會議注冊 |
第一天(7月22日) (基礎知識和數(shù)據(jù)庫) |
9:30-11:45 |
生物信息學導論 |
|
13:30-16:45 |
Linux基礎和軟件安裝
常用數(shù)據(jù)資源介紹(NCBI、 UCSC、UniProt等介紹) |
第二天(7月23日) (基因組測序數(shù)據(jù)分析) |
9:30-16:45 |
基因組組裝策略及方法
三代pacbio測序數(shù)據(jù)分析
基因組重測序及數(shù)據(jù)分析
微生物基因組功能注釋
真菌基因組功能注釋
上機操作:tablet,snpeff,velvet,BWA,
samtools, annovar,GATK等 |
第三天(7月24日) (轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析) |
9:30-16:45 |
RNAseq數(shù)據(jù)分析
miRNA數(shù)據(jù)分析
上機操作:BWA,samtools,cufflinks等 |
第四天(7月25日) (進化分析和基因芯片) |
9:30-16:45 |
進化分析
上機操作(clustalx,MEGA, phylip, Mrbayes等)
基于表達譜芯片的臨床數(shù)據(jù)分析
基因表達譜芯片數(shù)據(jù)分析及其基本處理流程 (上機操作:R分析) |
第五天 (7月26日) (蛋白質(zhì)組) |
9:30-16:45 |
蛋白質(zhì)鑒定和質(zhì)量控制
提高蛋白鑒定覆蓋度
蛋白質(zhì)搜庫上機
蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析(GO功能分類和富集分析
通路分析,網(wǎng)絡構(gòu)建)
上機操作:DAVID, Cytoscape+ BiNGO, GSEA, CateGOrizer,Cluster+Treeview,Mev,MotifX等。 |
注:
1.課程具體安排以報名當天的課程表為準。
2.應需要上機練習,請攜帶筆記本電腦,建議配置為4G內(nèi)存,10G空余硬盤空間。
收費標準
工作人員4600元/人,在校學生4100元/人 (含資料費和中餐)
其他優(yōu)惠:
1、同一單位2人以上參加蛋白質(zhì)組學前沿技術(shù)研習班,每人優(yōu)惠200元。
2、2014年7月5日之前匯款優(yōu)惠200元,以匯款回執(zhí)時間為準。
3、上海生咨生物科技有限公司的客戶或之前參加過研討班學員推薦學員優(yōu)惠300元。
以上優(yōu)惠可同時享受。
交通住宿費用自理,住宿預定需提前一周預定。
住宿協(xié)議酒店為海荷歐風酒店(準四星酒店)
協(xié)議價: 豪華標準房280元/天(含雙早)。注:合住每人140元/天,若湊不到合住的學員需支侍全價。
豪華大床房280元/天(含雙早)。
名額有限,提前匯款學員可優(yōu)先選擇前排座位,報名后因有事無法參加的學員請?zhí)崆埃敝苈?lián)系我們。
點此下載報名回執(zhí)表
付款方式:
1. 匯款:上海生咨生物科技有限公司
開戶銀行:中國農(nóng)業(yè)銀行上海星火支行
匯款帳號:03805500040008016
請在匯款前與我們電話聯(lián)系,匯款后將回單電子郵件發(fā)給我們,以便我們確認,匯款請注明“會議”+您的姓名。
聯(lián)系人:
許丹丹(ddxu@biorefer.com; 1377122204@qq.com)
手機: 189-1780-5836 座機:021-31131531
QQ: 1377122204
備用聯(lián)系人:
俞鴻 (hyu@biorefer.com; 425217020@qq.com)
手機:15900766827
2. 研習班報到當天現(xiàn)金支付。
講課專家信息
李亦學 教授
上海生物信息技術(shù)研究中心主任,中科院上海生命科學研究院系統(tǒng)生物學重點實驗室副主任,研究員,博士生導師。上海生物信息學會理事長,中科院“十一五”信息化專家組專家。曾任國家中長期發(fā)展規(guī)劃第十五專題組副組長,上海市2002年科學預見專家,中國科學院計劃局生命科學領域戰(zhàn)略發(fā)展專家組專家,國家“十五” 863計劃生物和農(nóng)業(yè)技術(shù)領域生物信息技術(shù)主題專家組組長,國家科技部中英E-Science國際合作計劃中方協(xié)調(diào)人。研究方向:蛋白質(zhì)組學研究,系統(tǒng)生物學研究。
蔡曉輝 副研究員
中國科學院上海生化細胞所獲生物信息學博士學位,畢業(yè)后先后在美國印第安娜大學計算生物學和生物信息學中心,加州大學圣地亞哥分校生物系統(tǒng)研究中心作為訪問學者從事博士后工作。2011年至今在上海生物信息技術(shù)研究中心任副研究員工作。研究方向包括蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)與功能關系,蛋白質(zhì)重要功能位點的識別,蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析以及二代測序數(shù)據(jù)分析,生物信息學數(shù)據(jù)庫和生物信息學算法開發(fā)等。
賈佳
新加坡海歸生物信息學博士 上海生物信息技術(shù)研究中心副研究員,生命科學數(shù)據(jù)中心負責人,主要從事生物醫(yī)藥信息數(shù)據(jù)資源開發(fā)和整合技術(shù)的研究。
金谷雷
浙江大學生物信息學博士杭州谷禾信息技術(shù)有限公司 總經(jīng)理 從事生物信息研究近10年,參與了包括國家973、863計劃以及自然科學基金等項目。研究階段獨立研發(fā)了Biopubinfo知識網(wǎng)絡平臺。擅長高通量測序數(shù)據(jù)分析。
徐昊
2001年起從事生物信息學數(shù)據(jù)分析工作,同濟大學生物工程碩士,分別在華大基因、上海生物信息技術(shù)研究中心、眾信生物技術(shù)有限公司擔任數(shù)據(jù)分析工程師職務,曾獲得國家杰出科學家證書。曾經(jīng)擔任過超過10期生物信息學培訓班講師,有豐富的培訓經(jīng)驗。熟悉常用數(shù)據(jù)庫以及分析軟件,生物信息學擅長分析領域為RNA-seq、微生物基因組分析,分析超過百個cDNA文庫和RNA-seq庫,對金黃色葡萄球菌,鉤端螺旋體、黃單胞菌等做過深入分析。
于復東
博士、副研究員。
2008年1月畢業(yè)于中國科學院上海生命科學研究院,獲生物信息學博士學位。畢業(yè)后一直從事二代測序等高通量數(shù)據(jù)分析、腫瘤基因組學、及相關數(shù)據(jù)庫開發(fā)和分析平臺建立等生物信息學研究工作。目前主要從事腫瘤基因組學方面的研究工作,運用系統(tǒng)生物學的方法研究可以應用于臨床早期診斷、預后、復發(fā)和轉(zhuǎn)移相關的分子標志物基因及其功能等。近年來作為項目負責人完成了國家自然科學基金、上海市博士后基金、上海市白玉蘭科技人才基金各一項,作為生物信息學分析平臺負責人完成傳染病重大專項課題一項,作為技術(shù)骨干參與完成863計劃項目一項,累積發(fā)表SCI論文十余篇。
俞鴻
現(xiàn)任上海生咨生物科技有限公司經(jīng)理,資深生物信息學工程師. 具有超過10年生物信息學分析經(jīng)驗。參與了水稻基因組、家蠶基因組、人肝蛋白質(zhì)組計劃以及其他的國家973、863計劃及國家自然科學基金等項目。主要從事蛋白質(zhì)組、基因組方向的分析。
會議地點及交通路線:
培訓地點:海荷歐風酒店,共和新路1130號
●上海虹橋機場(二號航站樓)距離酒店30公里;乘出租車約40分鐘,約80元可到酒店。坐2號地鐵到人民廣場換1號線到中山北路站下。
●上海浦東國際機場距離酒店44.17公里;乘出租車約45分鐘,約160元可到酒店。坐2號地鐵到人民廣場換1號線到中山北路站下。
●上;疖囌揪嚯x酒店2公里;乘出租車約5分鐘,約14元可到酒店。地鐵坐1號線到中山北路站下。
●上海火車南站距離酒店20公里;乘出租車約30分鐘,約60元可到酒店。地鐵坐1號線到中山北路站下。