多組學實驗及數(shù)據(jù)分析系列研習會(第三期)
之轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學和代謝組學
在后基因組時代,生命科學研究開始進入系統(tǒng)、全面、動態(tài)的功能探索階段。多種高通量的研究策略如基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、小RNA測序、蛋白質(zhì)組定量實驗和代謝組學被組合應用到同一個課題研究中,在原先單個平臺產(chǎn)出數(shù)據(jù)分析挖掘的的基礎上增加了多個實驗平臺產(chǎn)出數(shù)據(jù)的整合分析。本系列研習會將深入探討不同平臺的實驗方法、研究策略、實驗設計和數(shù)據(jù)分析,并介紹多組學實驗整合研究的案例,研討內(nèi)容由多年實踐經(jīng)驗的科研和技術人員進行講解和帶領數(shù)據(jù)分析的實際上機操作。
主辦單位:上海生咨生物科技有限公司
協(xié)辦單位:上海市藥物轉(zhuǎn)化工程技術研究中心
支持單位:上海維基生物科技有限公司
時間:2015年8月11日-8月15日
地點:上海良友飯店,靜安區(qū)南蘇州路1455號
上午(9:30-12:00) 1. 蛋白質(zhì)組學常用實驗方法 1.1 基于凝膠技術的定量蛋白質(zhì)組學 1.2 基于質(zhì)譜技術的蛋白質(zhì)組學研究 下午(13:30-17:30) 2.蛋白質(zhì)搜庫和差異蛋白篩選 2.1 蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析搜索引擎 2.2 如何提高蛋白鑒定覆蓋度 2.3 質(zhì)譜搜庫軟件演示和maxquant上機實習 2.4 差異蛋白篩選方法 上午(9:00-12:00) 3.轉(zhuǎn)錄組實驗設計和數(shù)據(jù)分析 3.1 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析及其在臨床醫(yī)學方面的應用研究 下午(13:30-17:30) 4.蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析 4.1 NCBI、UNIRPOT數(shù)據(jù)庫資源介紹 4.2 Gene Ontology介紹 4.3 KEGG網(wǎng)站介紹 4.4 蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析 上午(9:00-12:00) 5.蛋白相互作用網(wǎng)絡分析功能介紹和上機操作 5.1 cytoscape 5.2 pajek 5.3 STRING 下午(13:30-17:30) 6.常用分析上機練習包括: 6.1 維恩分析 6.2 層次聚類和熱圖 6.3 k-means聚類 6.4 主成分分析 6.5 GO功能分析和富集分析 6.6 KEGG通路分析 6.7 DESeq 上午(9:00-12:00) 7. 代謝組學研究方法 7.1 代謝組學實驗設計及樣本處理 7.2 代謝組學數(shù)據(jù)處理-多維統(tǒng)計分析 下午(13:30-17:30) 8. 多組學整合分析案例介紹 9. 科研工作中的專利挖掘和專利保護 自由上機和交流
注:1.課程具體安排以報名當天的課程表為準;
2.因需上機練習,請自帶筆記本電腦,默認是windows系統(tǒng),若安裝的是linux或蘋果iOS請自行下載上機軟件。
收費標準
單位代表3800元/人,學生3600元/人 (含資料費)
其他優(yōu)惠
1. 同一單位2人以上參會,每人優(yōu)惠100元。
2. 2015年8月1日之前匯款優(yōu)惠100元,以匯款回執(zhí)時間為準。
3. 上海市藥物轉(zhuǎn)化工程技術研究中心科研合作伙伴、上海生咨生物科技有限公司客戶、之前參會的學員郵件或手機短線推薦的與會者優(yōu)惠200元。
以上優(yōu)惠可以同時享受。
會議蓋章邀請函和發(fā)票于會議結(jié)束前發(fā)放
交通住宿費用自理,住宿預定需提前一周預定。
提前匯款安排前排座位
住宿協(xié)議酒店為 良友飯店,豪華標準間220元/天(含雙早),合住每人110元/天(若無法找到合住人需補差價)。
付款方式:
1. 匯款至 上海生咨生物科技有限公司
開戶銀行:中國農(nóng)業(yè)銀行上海奉賢環(huán)城東路支行
匯款帳號:03805500040008016
請在匯款前與我們電話聯(lián)系,匯款后將回單電子郵件發(fā)給我們,以便我們確認,匯款請注明“會議+姓名”。
聯(lián)系人:
許丹丹 (ddxu@biorefer.com; 1377122204@qq.com)
手機:189-1780-5836; 座機:021-31131531
2. 報到當天現(xiàn)金支付。
講師信息
侯辰瑞
資深蛋白質(zhì)組學工程師,具有超過10年的蛋白質(zhì)組學方向的從業(yè)經(jīng)歷,承接過大量的不同類型、不同物種的蛋白質(zhì)組學服務項目,在實驗設計和實施上有豐富的經(jīng)驗。
吳謙
博士 副研究員,上海生物信息技術研究中心質(zhì)譜平臺負責人,從事質(zhì)譜研究十多年,近年研究方向主要為蛋白質(zhì)組學、代謝組學及質(zhì)譜定量分析新方法開發(fā)。
于復東
博士、副研究員。2008年1月畢業(yè)于中國科學院上海生命科學研究院,獲生物信息學博士學位。畢業(yè)后一直從事二代測序等高通量數(shù)據(jù)分析、腫瘤基因組學、及相關數(shù)據(jù)庫開發(fā)和分析平臺建立等生物信息學研究工作。目前主要從事腫瘤基因組學方面的研究工作,運用系統(tǒng)生物學的方法研究可以應用于臨床早期診斷、預后、復發(fā)和轉(zhuǎn)移相關的分子標志物基因及其功能等。近年來作為項目負責人完成了國家自然科學基金、上海市博士后基金、上海市白玉蘭科技人才基金各一項,作為生物信息學分析平臺負責人完成傳染病重大專項課題一項,作為技術骨干參與完成863計劃項目一項,累積發(fā)表SCI論文十余篇。
俞鴻
上海生咨生物科技有限公司經(jīng)理,資深生物信息學工程師 具有超過10年生物信息學分析經(jīng)驗。參與了水稻基因組、家蠶基因組、人肝蛋白質(zhì)組計劃以及其他的國家973、863計劃及國家自然科學基金等項目。主要從事蛋白質(zhì)組、基因組方向的數(shù)據(jù)分析.
往期研習班照片回顧,網(wǎng)址: http://www.biorefer.com/biorefer/html/meeting/
|
|