上海生咨生物科技有限公司將于2016年7月24日-27日舉辦蛋白質組學數(shù)據(jù)分析研習會。本次研習會將幫助參加學習的人員深入了解當前蛋白質組學的主流實驗技術、實驗設計和數(shù)據(jù)分析方法,實際操作常用的蛋白質和蛋白質組數(shù)據(jù)分析方法,包括數(shù)據(jù)提取、差異蛋白篩選、層次聚類分類、主成分分析、GO功能分類和富集分析、通路分析和蛋白質相互作用分析等。
本次活動是我們組織的第5期蛋白質組學專題的研習會,因R語言在蛋白質組數(shù)據(jù)處理中應用非常多,與往期不同的是我們安排了一天時間重點講R的入門和R在蛋白質組數(shù)據(jù)分析中的一些應用,并提供R的分析示例腳本。
主辦單位:上海生咨生物科技有限公司
協(xié)辦單位:上海市藥物轉化工程技術研究中心
上海維基生物科技有限公司
講課時間:2016年7月25日-27日
簽到時間:7月24日14:30-17:30, 7月25日8:30-9:30
地點:上海中電大酒店,上海市浦東新區(qū)南泉北路1029號中電大廈(近張揚路)
7月24日(周日)14:30-17:30, 7月25日(周一)8:30-9:30 簽到。 | |
7月25日(周一) (9:30-17:30) |
1.1 基于質譜蛋白質組學技術在生命科學研究中的應用 1.2 蛋白質組學樣品處理注意事項 1.3 Maxquant軟件對實驗結果進行搜庫 1.4 Perseus軟件對差異蛋白質進行篩選 1.5 蛋白質組學數(shù)據(jù)分析 1.6 蛋白質組常用數(shù)據(jù)庫和網站 (Gene Ontology,KEGG,UniProt,NCBI等) |
7月26日(周二) (9:00-17:30) |
2.1 R語言入門和繪圖 維恩圖繪制,火山圖繪制,相關性分析和散點圖繪制,層次聚類和熱圖繪制,主成分分析,其他常用圖繪制等 2.2 用DAVID進行分析和后續(xù)繪圖 2.3 HemI熱圖繪制 2.4 MeV軟件聚類分析和熱圖 |
7月27日(周三) (9:00-17:30) |
3.1 BLAST+系列工具安裝和蛋白質序列重注釋(COG分析,GO注釋) 3.2 InterProscan介紹和分析演示 3.3采用STRING進行網絡分析 3.4用cytoscape進行蛋白蛋白相互作用網絡構建和計算 3.4 用pajek軟件尋找蛋白質相互作用網絡中兩蛋白的最段路徑 |
注:1.課程具體安排以報名當天的課程表為準;
2.因需上機練習,請自帶筆記本電腦,默認是windows7系統(tǒng),若安裝的是linux或蘋果iOS請自行下載上機軟件。我們所講解的軟件均是可以免費獲取的,但可能有操作系統(tǒng)的限制;
3.提前匯款或者預交訂金通過報名順序安排前排坐位。
收費標準
學術4300元/人, 企業(yè) 5800元/人(含資料費和中餐)
其他優(yōu)惠:
1.學生可憑有效學生證優(yōu)惠200元(注:只限脫產,在職研究生不在此列)
2.同一單位2人以上一同報名,每人優(yōu)惠200元。
3.2016年7月5日之前匯款優(yōu)惠100元,以匯款回執(zhí)時間為準。
4.上海市藥物轉化工程技術研究中心科研合作伙伴, 上海生咨生物科技有限公司客戶、之前參會的學員推薦者優(yōu)惠100元。
以上優(yōu)惠可以同時享受。
付款方式:
1.匯款至 上海生咨生物科技有限公司
開戶銀行:中國農業(yè)銀行上海奉賢環(huán)城東路支行
匯款賬號:03805500040008016
請在匯款前與我們電話聯(lián)系,匯款后將回單電子郵件發(fā)給我們,以便我們確認,匯款請注明“研習會+姓名”。
2. 報到當天現(xiàn)金支付或者刷卡。
聯(lián)系人
張軍閣(13301931853; 021-31131531;jgzhang@biorefer.com; QQ:1377122204)
其他
會議蓋章邀請函和發(fā)票于會議結束前發(fā)放;
交通住宿費用自理,因上海迪斯尼開業(yè)原因,酒店房間可能會緊張,住宿至少需提前一周預定;
住宿協(xié)議酒店為上海中電大酒店 ,豪華標準間/大床房 320元/天(含雙早),合住每人160元/天(若無法找到合住人需補差價),可代為預訂。周邊也有其他商務酒店,可在網上自行預訂。
2016年7月15日前取消報名,全額退還預付款或者訂金。若2016年7月15日后取消報名將扣除收費標準的15%后退回預付款,或者您也可全額用于下次參會使用。
講師信息
丁偉 工程師 多年蛋白質組學及蛋白質化學研究工作,具有豐富的的蛋白質組學實驗設計及培訓經驗 ,擅長于與蛋白質組學相關的實驗技術與相關數(shù)據(jù)分析方面。多篇論文發(fā)表于《Journal of Proteome Research》、《Proteomics》和《Plos one》等雜志。
吳謙 博士,副研究員,上海生物信息技術研究中心質譜平臺負責人,從事質譜研究十多年,近年研究方向主要為蛋白質組學、代謝組學及質譜定量分析新方法開發(fā)。
俞鴻 上海生咨生物科技有限公司經理,資深生物信息學工程師 具有近15年生物信息學分析經驗。參與了水稻基因組、家蠶基因組、人肝蛋白質組計劃以及其他的國家973、863計劃及國家自然科學基金等項目。主要從事蛋白質組、基因組方向的數(shù)據(jù)分析。
往期研習班照片回顧,網址: http://www.biorefer.com/biorefer/html/meeting/
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地點及交通路線:
地點:上海中電大酒店,上海市浦東新區(qū)南泉北路1029號中電大廈(近張揚路)
Ÿ 上海虹橋機場(二號航站樓)距離酒店19.8公里;乘出租車約43分鐘,約110元可到酒店。坐地鐵2線號到東昌路站下3號出口南泉北路口步行10分鐘。
Ÿ 上海浦東國際機場距離酒店40.6公里;乘出租車約56分鐘,約130元可到酒店。坐地鐵2號線到東昌路站下3號出口南泉北路口步行10分鐘。
Ÿ 上海火車站距離酒店9.5公里;乘出租車約26分鐘,約70元可到酒店。坐地鐵1號線到人民廣場站轉地鐵2號到東昌路站下3號出口南泉北路口步行10分鐘。
Ÿ 上海火車南站距離酒店15.5公里;乘出租車約44分鐘,約100元可到酒店。坐地鐵1號線到人民廣場站轉地鐵2號線到東昌路站下3號出口南泉北路口步行10分鐘。
Ÿ 上海市地鐵9號線到商城路站下2號出口步行5分鐘。