生物信息學(xué)-R語言繪圖與科技論文繪圖技術(shù)實操班通知

瀏覽次數(shù)：6253　發(fā)布日期：2016-8-30　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

關(guān)于舉辦“生物信息學(xué)最新技術(shù)”暨“生物信息繪圖技術(shù)與實踐”高級培訓(xùn)班的通知

各有關(guān)單位:

生物信息實驗中的海量離散數(shù)據(jù)蘊(yùn)含著各種顯著或潛在的規(guī)律和特征，這些規(guī)律或特征通常被淹沒在隨機(jī)信號和實驗誤差之中。將數(shù)據(jù)變?yōu)橹庇^的圖表，不僅可以形象化的展現(xiàn)數(shù)據(jù)中的這些規(guī)律，還能表現(xiàn)出數(shù)據(jù)之間存在著各種直接或間接的聯(lián)系（如包含、延伸、對照、線性等）。因此生物信息繪圖技術(shù)是在生物研究中非常重要的工具，能夠大幅提高研究者的科研效率，在實驗數(shù)據(jù)分析、科技論文寫作中不可或缺。生物信息繪圖軟件非常多，功能也各有不同，為了滿足廣大生物科技研究人員的迫切需要，北京海淀中科計算技術(shù)轉(zhuǎn)移中心（中科院計算所技術(shù)轉(zhuǎn)移中心）舉辦“生物信息學(xué)最新技術(shù)”暨“生物信息繪圖技術(shù)與實踐”高級培訓(xùn)班，并由北京嘉誠永恒科技有限公司具體承辦。“智能信息處理技術(shù)”為人力資源與社會保障部中國科學(xué)院北京分院國家級專業(yè)技術(shù)人員繼續(xù)教育基地培訓(xùn)點培訓(xùn)項目，“生物信息”為智能信息處理技術(shù)系列培訓(xùn)項目之一。具體事宜通知如下：

一、培訓(xùn)目標(biāo)及特點：

本培訓(xùn)邀請的主講人均是有理論和實際研究經(jīng)驗的人員。學(xué)員通過與專家直接交流，能夠分享到這些頂尖學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的研究經(jīng)驗和實驗設(shè)計的思路。學(xué)員通過集中專題學(xué)習(xí)后能夠擴(kuò)展思路，在研究技術(shù)方面領(lǐng)悟更多。

二、培訓(xùn)對象：

大中專院校生物信息、生物計算、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、計算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)類專業(yè)的課程負(fù)責(zé)人、一線教師、教研室骨干人員、教學(xué)管理人員；科研單位從事生物、生命科學(xué)、微生物研究的相關(guān)人員；生物、醫(yī)藥、化學(xué)及相關(guān)企業(yè)的領(lǐng)導(dǎo)與技術(shù)骨干。

三、時間地點：2016年9月22日—9月26日北京

（時間安排：第1天報到，授課4天）

四、培訓(xùn)內(nèi)容：

一、科技論文繪圖概論	科技期刊對繪圖（figure）的具體要求和各種圖片格式及應(yīng)用場景介紹；根據(jù)具體要求聯(lián)合應(yīng)用Photoshop和Illustrator進(jìn)行單張圖片的調(diào)整、整合和輸出；圖片細(xì)節(jié)的調(diào)整和美化，包括線條的快速調(diào)整、標(biāo)尺的制作、文字的編排等；利用Mindmanager和億圖圖示專家等專業(yè)軟件進(jìn)行 “思路圖”和科研項目流程圖的繪制。
二、R語言基礎(chǔ)	R語言簡介、功能及基本語法介紹
三、R語言功能及應(yīng)用案例	R語言簡介、功能及基本語法介紹及實際操作 1）（散點圖--點線混合圖、并列散點圖、坐標(biāo)對數(shù)化 2）條形圖-標(biāo)準(zhǔn)條形圖、推積條形圖、鄰接條形圖、Error Bar 形 3）圖文氏圖 4）餅圖--二維餅圖、三維餅圖 5）盒形圖--(箱線圖) 6）經(jīng)驗分布圖 7）頻率直方圖 8）及熱圖（三種熱圖不同作圖方法）等的繪制
四、ggplot2的使用	掌握ggplot2繪圖相關(guān)命令，以及常見圖表（條形圖，折線圖，散點圖，直方圖以及密度圖等。添加注釋，分頁以及配色，坐標(biāo)軸調(diào)整）
五、R在統(tǒng)計學(xué)中的應(yīng)用	使用R做一些常用的統(tǒng)計分析。假設(shè)檢驗；回歸分析、方差分析；主成分分析、聚類分析等等（以生物、醫(yī)學(xué)和生態(tài)相關(guān)內(nèi)容為例）
六、使用R語言進(jìn)行生物信息學(xué)相關(guān)的分析	使用R語言相關(guān)的包對轉(zhuǎn)錄組等組學(xué)的高通量測序數(shù)據(jù)進(jìn)行差異表達(dá)、富集分析等。
六、使用R語言進(jìn)行生物信息學(xué)相關(guān)的分析	生物信息學(xué)專業(yè)圖KEGG、GO等的繪制方法與運(yùn)用R語言進(jìn)行實現(xiàn)
七、進(jìn)化分析及作圖	基本進(jìn)化樹構(gòu)建方法（MEGA）,模型評估（MEGA），進(jìn)化樹注釋（Evolview）
八、科技論文繪圖及修圖基礎(chǔ)	科技論文圖表要求；繪圖基礎(chǔ)知識、圖文件類型、來源與繪制方法介紹；常規(guī)繪圖與實現(xiàn)方法及軟件學(xué)習(xí)（powerpoint、visio、adobe illustrator等）
九、生物信息學(xué)專業(yè)常用工具及繪圖方法	運(yùn)用生物信息常用的工具進(jìn)行專業(yè)繪圖及格式轉(zhuǎn)換；學(xué)BioEdit、WeGO等常用生物學(xué)專業(yè)軟件的圖表及格式轉(zhuǎn)換
十、數(shù)據(jù)分析繪圖工具origin的使用	使用origin軟件進(jìn)行圖形繪制、編輯以及曲線擬合等數(shù)據(jù)分析操作
十一、基因組可視化軟件circos的使用	使用circos繪制基因組圈圖

五、主講專家：

主講專家來自中科院等科研機(jī)構(gòu)的高級專家，擁有豐富的科研及工程技術(shù)經(jīng)驗，長期從事生物信息領(lǐng)域項目研究，具有資深的技術(shù)底蘊(yùn)和專業(yè)背景。

六、頒發(fā)證書：

學(xué)員經(jīng)培訓(xùn)考試合格后可以獲得：

1．由北京海淀中科計算技術(shù)轉(zhuǎn)移中心頒發(fā)的《生物信息工程師》培訓(xùn)證書。

注：請學(xué)員帶兩寸彩照2張（背面注明姓名）、身份證復(fù)印件一張。

七、報名辦法及費(fèi)用：

每人￥4800元（含報名費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、考試費(fèi)、證書相關(guān)費(fèi)用）食宿統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。請各有關(guān)部門統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報名參加培訓(xùn)，各單位也可直接報名參加，報名回執(zhí)表請傳真至?xí)⻊?wù)處。