高通量測序應用最新技術(shù)與數(shù)據(jù)分析高級培訓班通知

瀏覽次數(shù)：5093　發(fā)布日期：2016-12-13　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

關于舉辦“高通量測序應用最新技術(shù)與數(shù)據(jù)分析”高級培訓班通知

2017年南寧基因組高通量測序分析及生物信息繪圖上機實操班

各有關單位:

隨著新一代高通量測序技術(shù)的快速發(fā)展，在準確度大大提高的前提下, 進一步降低測序成本。由此不斷產(chǎn)生出巨量的分子生物學數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)有著數(shù)量巨大、關系復雜的特點，以至于不利用計算機根本無法實現(xiàn)數(shù)據(jù)的存儲和分析。隨著生物信息學作為新興學科迅速蓬勃發(fā)展，正在改變?nèi)藗冄芯可镝t(yī)學的傳統(tǒng)方式，高通量測序技術(shù)以及數(shù)據(jù)分析技術(shù)已成為探索生物學底層機制和研究人類復雜疾病診斷、治療及預后的重要工具，廣泛應用于生命科學各個領域，是21世紀生命科學與生物技術(shù)的重要戰(zhàn)略前沿和主要突破口。“智能信息處理技術(shù)”為人力資源與社會保障部中國科學院北京分院國家級專業(yè)技術(shù)人員繼續(xù)教育基地培訓點培訓項目，“生物信息”為智能信息處理技術(shù)系列培訓項目之一。為進一步推動我國生物信息學特別是基因組學的發(fā)展，提高從業(yè)人員的技術(shù)水平，北京海淀中科計算技術(shù)轉(zhuǎn)移中心（中科院計算所技術(shù)轉(zhuǎn)移中心）舉辦“高通量測序應用最新技術(shù)與數(shù)據(jù)分析”高級培訓班，并由北京嘉誠永恒科技有限公司具體承辦，具體事宜通知如下：

一、培訓目標及特點：

本培訓以第三代測序、第四代測序技術(shù)的應用與數(shù)據(jù)分析、基因組、轉(zhuǎn)錄組為主題，精心設計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。培訓邀請的主講人均是有理論和實際研究經(jīng)驗的人員。學員通過與專家直接交流，能夠分享到這些頂尖學術(shù)機構(gòu)的研究經(jīng)驗和實驗設計思路。學員通過集中專題學習后能夠擴展思路，在研究技術(shù)方面領悟更多。

二、培訓對象：

大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫(yī)學、化學、農(nóng)學、計算機科學、數(shù)學類專業(yè)的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員；科研單位從事生物、生命科學、微生物研究的相關人員；生物、醫(yī)藥、化學及相關企業(yè)的領導與技術(shù)骨干。

三、時間地點：2017年1月12日——1月16日南寧 （時間安排：第1天報到，授課4天）

四、培訓內(nèi)容

章節(jié)	內(nèi) 容
生物信息學介紹	生物信息學介紹與前沿技術(shù)動態(tài)
序列的比對	1、全局比對 Clustalw,Muscle,Hmmer 2、局部比對 Blast, Sim4,Genewise 3、序列比對算法分析
基因組/基因注釋分析	1、新一代測序技術(shù)原理和數(shù)據(jù)處理介紹 2、基因組拼接與組裝基因組de novo組裝方法重復序列分析技術(shù) 3、 RNA分析 tRNA,rRNA,microRNA,snoRNA RNA干擾，SiRNA預測技術(shù) 4、基因預測原核：Glimmer，真核：Genescan, Augustus 5、基因功能注釋及常用的數(shù)據(jù)庫介紹
基因組學研究概述	1、structural genomics: 結(jié)構(gòu)基因組學 2、functional genomics: 功能基因組學 3、Drug discovery: 藥物研發(fā) 4、Personalized medicine：個性化、精細醫(yī)療
DNA測序技術(shù)-轉(zhuǎn)錄組分析的進化	1、第一代測序技術(shù)：Sanger測序原理 2、第二代測序技術(shù)：Illumina，454, Ion Torrent原理 3、第三代測序技術(shù)：PacBio, Hellicos原理 4、第四代測序技術(shù): Oxford NanoPore原理 5、其他技術(shù)Hybridization based methods (NabSys)
Experimental procedure for transcriptomic analysis	Introduction Number of duplications Sequencing coverage Transcriptomic analysis using NGS (RNA-Seq) Transcriptomic analysis using PacBio (Iso-Seq) IsoSeq Experimental design
Data analysis （part 1）：data pre-processing	evaluation of data quality 數(shù)據(jù)分析 Data format，fasta，fastq，quality value，gff3 Data cleanup Quality filter, trimmer, clipper
Data analysis （part 2）：reference free analyses（無參轉(zhuǎn)錄組分析）	Gene discovery Trinity de novo transcriptome assembly Analysis of Differential Expressed Gene （DEGs） Abundance estimation using RSEM Differential expression analysis using EdgeR Explore the results (cummerbund) MA plot, Volcano plot, False Discovery Rate (FDR) hierarchical two-way clustering, pairwise sample-distance, gene expression profiles.
使用R語言進行生物信息學相關的分析	使用R語言相關的包對轉(zhuǎn)錄組等組學的高通量測序數(shù)據(jù)進行差異表達、富集分析等。生物信息學專業(yè)圖KEGG、GO等的繪制方法與運用R語言進行實現(xiàn)
基因組可視化軟件circos的使用	使用circos繪制基因組圈圖
生物信息學專業(yè)常用工具及繪圖方法	應用生物信息常用的工具進行專業(yè)繪圖及格式轉(zhuǎn)換；學BioEdit、WeGO等常用生物學專業(yè)軟件的圖表及格式轉(zhuǎn)換

五、主講專家：

主講專家來自中科院等科研機構(gòu)的高級專家，擁有豐富的科研及工程技術(shù)經(jīng)驗，長期從事生物信息領域項目研究，具有資深的技術(shù)底蘊和專業(yè)背景。

六、頒發(fā)證書：

學員經(jīng)培訓考試合格后可以獲得：

1．由人力資源與社會保障部中國科學院北京分院國家級專業(yè)技術(shù)人員繼續(xù)教育基地頒發(fā)專業(yè)技術(shù)人員高級研修項目證書。該證書可作為專業(yè)技術(shù)人員考核、職稱評聘、崗位聘任、職業(yè)注冊的重要依據(jù)。

2．由北京海淀中科計算技術(shù)轉(zhuǎn)移中心頒發(fā)的《高通量測序應用最新技術(shù)與數(shù)據(jù)分析》培訓證書。

注：請學員將電子版照片1張（背注明姓名）發(fā)送指定郵箱、身份證復印件一張。

七、報名辦法及費用：

每人￥4300元（含報名費、培訓費、資料費），住宿可統(tǒng)一安排，費用自理。請各有關部門統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報名參加培訓，各單位也可直接報名參加，報名回執(zhí)表請傳真至會務處。

八、聯(lián)系方式：

聯(lián)系方式：張琦聯(lián)系電話：17310133545
聯(lián)系郵箱：hdzkyjsjs@163.com 聯(lián)系QQ：1206492125（請備注南寧培訓）

中國科學院計算技術(shù)研究所北京海淀中科計算技術(shù)轉(zhuǎn)移中心 北京嘉誠永恒科技有限公司

二零一六年十二月十一日

我要報名

分享到：QQ空間新浪微博騰訊微博微信

【所有新聞】【本類新聞】【相關產(chǎn)品】【關閉窗口】

相關鏈接

本類新聞

關于我們 | 法律聲明 | 廣告報價 | English | 網(wǎng)站地圖