數(shù)字PCR是一種精準的核酸絕對定量技術,可對目標基因進行絕對定量,具有卓越的靈敏度和精準度。其靈敏度高的關鍵因素在于將PCR混合液分割成數(shù)萬個油包水的獨立微滴。液相和油相之間的界面上發(fā)生的化學相互作用可能會影響PCR擴增效率。PCR預混液的組成和性能對于確保靶點的有效擴增和微滴穩(wěn)定性至關重要。naica® multiplex PCR MIX是數(shù)字PCR頭部企業(yè)法國Stilla Technologies公司生產(chǎn),專用于在naica® 微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),在整個檢測動態(tài)范圍內(nèi),提供強大的微滴穩(wěn)定性和卓越線性范圍的多重目標基因的定量檢測。
為了達到最佳靈活性和靈敏度,我們提供5X和10X濃度的naica® multiplex PCR MIX以降低MIX用量,從而使得更多的反應體積可供更多的模板、引物或探針的加入。
naica® multiplex PCR MIX可在naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)的動態(tài)范圍內(nèi)對多個靶點進行同時定量,并保持良好線性。
采用0.2到13000cp/uL的DNA樣本,使用10X naica® multiplex PCR MIX,在naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)上進行三個靶點的同時檢測(圖1)。高濃度的PCR MIX(5倍和10倍濃度均可使用)可使樣本輸入體積最大化,從而提高低濃度樣本中目標靶點的檢測能力。
▲ 圖1:使用naica® multiplex PCR MIX同時對3個靶點(BRAF、ALB和pUC18)進行線性定量。將人類基因組(hg)DNA和pUC18質粒進行連續(xù)稀釋(0.2、1.5、8.0、50、320、2050和13000cp/uL),各稀釋液進行3次重復檢測。結果顯示各靶點的線性關系好,R2均大于0.99,說明結果高度真實可靠。
在多重檢測中可以對低濃度靶點進行穩(wěn)定且靈敏的檢測。
多重檢測中多個靶點的共擴增比單個靶點的擴增更為復雜,可能會因為潛在的干擾和反應復雜性的影響,導致多重檢測的線性范圍降低。在naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)上使用naica® multiplex PCR MIX分別進行3重和單重檢測(圖2),結果發(fā)現(xiàn),不管是在高濃度的外部靶點(BRAF和ALB hgDNA)存在的情況下(圖2A)還是在外部靶點不存在的情況下(圖2B),兩組實驗中pUC18線性量化的動態(tài)范圍一致,且陽性微滴和陰性微滴群組的熒光水平和可分性也高度一致。此外,不管是單重還是3重檢測,pUC18靶點都能得到可靠的定量(圖3),且檢測范圍和線性度一致。
▲ 圖2:使用naica® multiplex PCR MIX進行的3重和單重擴增的比較。將pUC18質粒的13000至0.2 cp/uL的系列稀釋液在2個外部擴增靶點背景下(每個靶標為3000cp/uL,圖A))和在不含外部靶點(圖B)的情況下進行定量檢測,3次重復。結果顯示,3重和單重擴增中pUC18的檢測結果高度一致。注:3重和單重的反應液中均含有pUC18、BRAF和ALB的特異性引物探針。
▲圖3:使用naica® multiplex PCR MIX的擴增結果真實可靠。采用13000-0.2cp / uL的pUC18 DNA稀釋液進行3重(A)和單重檢測(B),各稀釋液進行3次重復。(A) 3重反應中額外加入3000cp / uL(10ng)的hgDNA模板;(B) 單重反應中沒有額外加入hgDNA模板。結果顯示,3重和單重反應中,pUC18均能獲得真實可靠的定量結果,同時檢測范圍和線性高度一致;3重反應中BRAF和ALB檢測也具有良好的重復性,相對標準偏差在2.3-2.5%之間,n=21。
訂購信息:
Eva Green®染料法的naica® PCR Mix也可訂購。