講座：基于深度學(xué)習(xí)DIA數(shù)據(jù)分析及腫瘤新生抗原發(fā)現(xiàn)

金秋九月，豆谷科技將聯(lián)合BSI于2021年9月28日推出基于PEAKS Online高靈敏度高通量的DIA完整數(shù)據(jù)分析及腫瘤新生抗原解決方案的免費(fèi)在線講座。由高級(jí)應(yīng)用工程師李文婷為大家介紹PEAKS Online的軟件平臺(tái)，并由BSI的單寶珍博士和大家一起探討AI賦能腫瘤新生抗原發(fā)現(xiàn)解決方案。期待各位同行，老師和同學(xué)們參與！
 

講座內(nèi)容：
 

一、PEAKS Online基于深度學(xué)習(xí)的DIA完整工作流

時(shí)間：2021年9月28日14:30-15:10

主講人：李文婷（高級(jí)應(yīng)用工程師）
 

二、AI賦能腫瘤新生抗原發(fā)現(xiàn)

時(shí)間：2021年9月28日15:10-15:50
 

主講人：?jiǎn)螌氄?博士，CEO & CSO
 

講座背景介紹：

基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)采集方式已從數(shù)據(jù)依賴性采集(DDA)走向數(shù)據(jù)非依賴性采集(DIA)，這主要是由于DIA可為用戶提供額外的豐富信息。然而，一直以來(lái)，DIA數(shù)據(jù)的處理分析仍然具有挑戰(zhàn)性。比如，搜索這些數(shù)據(jù)通常需要一個(gè)巨大的譜圖庫(kù)，而這個(gè)譜圖庫(kù)是由DDA模式下運(yùn)行的高度分餾的樣本產(chǎn)生的，這實(shí)際上與DIA的目的是不相符的�；�于深度學(xué)習(xí)的譜圖預(yù)測(cè)模型的最新進(jìn)展使得通過(guò)預(yù)測(cè)譜圖和保留時(shí)間來(lái)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索成為可能，并且深度學(xué)習(xí)還可以對(duì)DIA數(shù)據(jù)進(jìn)行多肽從頭測(cè)序，從而鑒定出ORFs以外的多肽。今年BSI開(kāi)發(fā)推出了PEAKS Online的DIA全工作流，集成譜圖庫(kù)搜索、數(shù)據(jù)庫(kù)搜索及多肽從頭測(cè)序，實(shí)現(xiàn)可以對(duì)DIA和DDA數(shù)據(jù)進(jìn)行準(zhǔn)確全面分析的高通量處理。對(duì)多肽的鑒定和定量具有超高的靈敏度和準(zhǔn)確度。以免疫多肽組分析為例，PEAKS Online 對(duì)免疫多肽組的DIA數(shù)據(jù)分析，僅僅在譜圖庫(kù)搜索的結(jié)果，HLA-bound peptide的鑒定結(jié)果比之前文獻(xiàn)報(bào)道的多約50-200%。并且，通過(guò)不同方法對(duì)HLA-bound peptide的結(jié)合基序分析，都表現(xiàn)出非常高的特異性。
 

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關(guān)于豆谷科技

上海豆谷信息科技有限公司是一家致力于為蛋白質(zhì)組學(xué)和抗體生物藥領(lǐng)域的科研工作者提供基于質(zhì)譜的數(shù)據(jù)分析軟件和服務(wù)整體解決方案的公司，是加拿大Bioinformatics Solutions Inc在中國(guó)的獨(dú)家代理，負(fù)責(zé)軟件全系列產(chǎn)品和服務(wù)的商務(wù)、銷售和技術(shù)工作，主要包括：PEAKS AB及抗體測(cè)序與表征服務(wù)，PEAKS Studio、PEAKS Online等

關(guān)于BSI

BSI是世界領(lǐng)先的生物信息軟件和服務(wù)公司，位于加拿大享有“硅谷”之稱的安大略省滑鐵盧市。BSI在質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域擁有多年的經(jīng)驗(yàn)積累，為迅猛發(fā)展的基因組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)和生物技術(shù)行業(yè)提供了世界領(lǐng)先的算法和軟件解決方案及質(zhì)譜分析服務(wù)。旗下著名的PEAKS軟件平臺(tái)在全世界范圍內(nèi)擁有上千家學(xué)術(shù)和工業(yè)界用戶。2016年ASMS期間BSI又隆重推出的PEAKS AB軟件平臺(tái)更是一經(jīng)推出即獲得多家生物制藥公司的青睞。