單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)做完了,數(shù)據(jù)分析太復(fù)雜?我是生信小白,代碼啥跟啥?又或者看著別人分析好像懂了,自己一動(dòng)手就“我又學(xué)廢了”?金秋十月,在這最美的豐收時(shí)節(jié),由怡美通德主辦的2021年首期10x Genomics單細(xì)胞生信培訓(xùn)班成功舉辦,小班教學(xué),包教包會(huì),學(xué)員們感覺干貨多多,收獲滿滿~
為了讓學(xué)員們都能真正做到“眼看會(huì)了,手也會(huì)了”,我們特意安排了線下培訓(xùn)班,采用理論與實(shí)操相結(jié)合的形式,讓生信零基礎(chǔ)的小伙伴也能做到現(xiàn)學(xué)現(xiàn)用,數(shù)據(jù)分析不再愁,這種形式也受到了學(xué)員的一致好評(píng)。
首先,由怡美通德數(shù)據(jù)分析主管殷汝雷為大家介紹北鯤云分析平臺(tái)的功能及使用方法,我們?yōu)槊總(gè)學(xué)員都開通了免費(fèi)且可獨(dú)立操作的賬號(hào),無需服務(wù)器,在電腦網(wǎng)頁端登錄賬號(hào)即可進(jìn)行操作,簡單好上手。接下來,汝雷介紹了10x Genomics的開源數(shù)據(jù)分析軟件Cell Ranger的 pipeline,演示了ount、aggr及 reanalyze三大主要功能,從軟件下載、運(yùn)行到到如何拆分?jǐn)?shù)據(jù)、得到表達(dá)矩陣、合并樣本等。然后,汝雷又詳細(xì)講解并演示了10x Genomics 的開源數(shù)據(jù)可視化軟件Loupe Browser的安裝使用,如何根據(jù)已知細(xì)胞類型的marker基因?qū)?xì)胞進(jìn)行注釋和圈選、聚類,如何進(jìn)行差異分析,得到直觀的細(xì)胞聚類圖、小提琴圖等,并帶著學(xué)員們進(jìn)行實(shí)操和答疑。最后,由百奧智匯的技術(shù)支持李曉敏為大家介紹了第三方分析軟件-由百奧智匯自主研發(fā)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析軟件OmniAnalyzer,使用普通電腦即可運(yùn)行,提供從原始數(shù)據(jù)處理到終端數(shù)據(jù)分析的一站式解決方案。
一天的培訓(xùn)班圓滿收官,緊湊而充實(shí)的課程安排,讓學(xué)員們受益匪淺。通過敲擊鍵盤輸入一些簡單的命令即可得到想要的結(jié)果,大家紛紛表示原來生信分析也不是那么遙不可及,感受到了生信分析的魅力。小編也預(yù)祝所有參加培訓(xùn)班的學(xué)員都能取得理想的分析結(jié)果,早日發(fā)表高分文章!
錯(cuò)過本次培訓(xùn)班怎么辦,不用擔(dān)心,我們會(huì)根據(jù)此次培訓(xùn)班學(xué)員的反饋對(duì)課程進(jìn)行調(diào)整和優(yōu)化,舉辦更多更精彩的培訓(xùn)班,敬請(qǐng)期待!
怡美通德現(xiàn)與北鯤云、百奧智匯達(dá)成戰(zhàn)略合作,旨在為不具備專業(yè)單細(xì)胞軟件分析工具和服務(wù)器等軟硬件條件的科研人員,提供簡單好上手的單細(xì)胞生信分析軟件及工具,對(duì)單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)進(jìn)行完整的生信分析。