在讀板機(jī)上進(jìn)行基于時(shí)間分辨熒光標(biāo)記的Western Blot蛋白檢測(cè)和定量
Vanitha Thulasiraman1, Jia-Ren Lin2, Cathy Olsen1, Rainer Muehlbacher3, Brian Quast1,
Michael Katzlinger3, Josef Atzler3, Karlene A. Cimprich2, Evan F. Cromwell1 1Molecular Devices LLC, Sunnyvale, California, USA; 2Department of Chemical & Systems Biology,Stanford University, Stanford, California, USA; 3Molecular Devices GmbH, Salzburg, Austria
摘要
蛋白檢測(cè)在制藥和臨床研究領(lǐng)域是一項(xiàng)非常重要的項(xiàng)目,而Western Blot(WB)檢測(cè)則是眾多蛋白檢測(cè)方法中最常見的一種。目前,檢測(cè)轉(zhuǎn)印到WB膜上蛋白的技術(shù)眾多,包括熒光標(biāo)記、銀染和化學(xué)發(fā)光法等?墒,每一種技術(shù)都有其局限,人們一直致力于尋找提高WBs定量準(zhǔn)確度和動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍的技術(shù)方法。這里,介紹一種最新的在SpectraMax i3或Paradigm多功能酶標(biāo)儀上檢測(cè)WBs膜的蛋白分析方法。膜上使用銪元素-螯合物或鏈霉素標(biāo)
記二抗特異結(jié)合被研究的蛋白。銪元素標(biāo)記具有長(zhǎng)熒光壽命周期,可至1ms級(jí)別,所以熒光的檢測(cè)采用時(shí)間分辨的模式,從而可以減少來自于自發(fā)熒光和其他短壽命周期的雜光的背景。WBs膜被置于酶標(biāo)儀內(nèi),然后使用TRF卡盒進(jìn)行WBs膜優(yōu)化掃描。此方法不涉及酶的檢測(cè),加之銪元素-螯合物標(biāo)記物具有很強(qiáng)的光漂白抗性,因而信號(hào)十分穩(wěn)定能至幾周到幾個(gè)月,這就允許對(duì)膜進(jìn)行重復(fù)掃描以及可能進(jìn)行不同條帶的強(qiáng)度對(duì)比以及根據(jù)標(biāo)品進(jìn)行更精確的定量。TRF檢測(cè)方式采用單光子計(jì)數(shù)模式,所以理論的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍為>105。實(shí)際應(yīng)用中,動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍則受限于高含量條帶的熒光飽和以及非特異性結(jié)合造成的背景因素。由于不使用CCD不會(huì)出現(xiàn)高光溢出現(xiàn)象,而這卻是化學(xué)發(fā)光和普通熒光檢測(cè)的常見問題,所以此方法能夠提供非常銳利的條帶和出色的圖像質(zhì)量。這一新穎的多功能酶標(biāo)儀檢測(cè)平臺(tái)上的Sc a n l a t e r Western Blot檢測(cè)系統(tǒng)以其操作簡(jiǎn)便、檢測(cè)靈敏和信號(hào)的超高穩(wěn)
定性,提供了出色的WBs檢測(cè)性能表現(xiàn),必將給多功能酶標(biāo)儀在實(shí)驗(yàn)室應(yīng)用方面帶來又一重大突破!
原理
ScanLater Western Blot檢測(cè)系統(tǒng)簡(jiǎn)化了Western Blot的流程,二抗使用銪元素-螯合物標(biāo)記物,掃描在酶標(biāo)儀上進(jìn)行。不需要底物,膜洗滌后直接進(jìn)行掃描檢測(cè)。銪元素具有長(zhǎng)熒光壽命周期,至1ms,檢測(cè)模式使用時(shí)間分辨模式(TRF),可以極大減弱自發(fā)熒光和其余短壽命背景雜光。
Figure 1. 上左:蛋白檢測(cè)示意圖。二抗直接使用銪元素標(biāo)記。上右:銪元素-螯合物激發(fā)和發(fā)射光譜。下右:TRF檢測(cè)模式,銪元素的熒光周期與背景熒光的衰減周期對(duì)比,信號(hào)的檢測(cè)采取一定時(shí)間延遲,從而去除背景熒光干擾。
材料與方法
材料
• Scanlater Western Blot試劑盒(10X Washing Buffer, 5X Blocking Buffer, Eu-Labeled Anti-Mouse IgG, Eu-Labeled Anti-Rabbit IgG, Eu-Labeled Streptavidin),由Molecular Devices, LLC.提供。
• Western Blot膜使用SpectraMax Paradigm或SpectraMax i3 多功能讀板機(jī)進(jìn)行掃描(Molecular Devices)。
• 谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(GST), 生物素化兔抗GST, 鼠抗-GST, 兔抗轉(zhuǎn)鐵蛋白,轉(zhuǎn)鐵蛋白(Abcam)。化學(xué)發(fā)光底物和HRP-二抗(Millipore)。
• TGX 4-20% 膠,雙標(biāo)記蛋白標(biāo)品,電泳緩沖液,上樣緩沖液,轉(zhuǎn)印緩沖液,蛋白轉(zhuǎn)印系統(tǒng)(Bio-Rad Laboratories), Immobilon FL膜(Millipore)。
方法
• 在200V電壓下,蛋白于TGX 4-20%中,跑膠30min,之后使用Trans Blot Turbo電轉(zhuǎn)印7min到PVDF膜上,然后使用TBST漂洗30s,再用1X封閉液封閉1h。
• 一抗以一定比稀釋比例直接加到封閉液中,室溫下放置2小時(shí)或4℃過夜,1X洗液洗膜三次,每次5min。
• 二抗按照1:5000使用1X封閉液進(jìn)行稀釋,然后加到膜上孵育60min,然后1X洗液洗膜三次,每次5min,最后在去離子水中漂洗15s,晾干準(zhǔn)備進(jìn)行掃描。
• 在SpectraMax Paradigm或 SpectraMax i3多功能讀板機(jī)上進(jìn)行掃描檢測(cè),使用SoftMax® Pro軟件進(jìn)行分析。
靈敏度和動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍
使用GST進(jìn)行靈敏度和動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍測(cè)試,使用1X上樣液三倍梯度稀釋GST,然后加到4-20%梯度膠中跑膠30min,然后轉(zhuǎn)印到Immobilon FL膜上,使用生物素標(biāo)記的兔抗-GST標(biāo)記2小時(shí),之后與Eu-標(biāo)記的鏈霉素孵育1小時(shí),然后洗膜,晾干使用SpectraMax Paradigm多功能酶標(biāo)儀進(jìn)行掃描。系統(tǒng)表現(xiàn)出亞-皮克級(jí)的檢測(cè)靈敏度和>4logs的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍。
Figure 2. 上圖: SpectraMax Paradigm掃描的GST梯度稀釋標(biāo)品圖像(注:偽彩標(biāo)尺用來顯示大的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍);下圖:為每個(gè)條帶的總體熒光強(qiáng)度,統(tǒng)計(jì)顯示整個(gè)動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍為4logs,線性檢測(cè)范圍為3logs,圖像分析使用Image J。
信號(hào)穩(wěn)定性
銪元素-標(biāo)記的一個(gè)最突出的優(yōu)點(diǎn)之一是信號(hào)的穩(wěn)定性以及對(duì)光漂白的抗性,以致western膜印記條帶的穩(wěn)定性可達(dá)數(shù)月之久。為了顯示這一點(diǎn),我們將三倍梯度稀釋的轉(zhuǎn)鐵蛋白進(jìn)行跑膠(4-20%梯度膠)30min,然后轉(zhuǎn)印Immobilon FL膜上,4℃與兔抗-轉(zhuǎn)鐵蛋白過夜孵育,然后與銪元素-標(biāo)記的抗兔IgG 4℃孵育1小時(shí),然后洗膜,晾干,使用SpectraMax Paradigm分別于當(dāng)天和一個(gè)月之后進(jìn)行掃描。
• 信號(hào)經(jīng)過30天也幾乎沒有損失
• 高度可定量結(jié)果
此外,條帶可以進(jìn)行多次重復(fù)掃描,信號(hào)也不會(huì)降低,將2倍梯度稀釋的轉(zhuǎn)鐵蛋白跑膠(4-20%梯度膠)30min,然后轉(zhuǎn)印Immobilon FL膜上,與兔抗-轉(zhuǎn)鐵蛋白孵育2小時(shí),然后與銪元素-標(biāo)記的抗兔IgG 4℃孵育1小時(shí),然后洗膜,晾干,使用SpectraMax Paradigm進(jìn)行多次掃描。
應(yīng)用
• 使用Scanlater Western Blot技術(shù)檢測(cè)痕量表達(dá)的內(nèi)源性泛素化Rad-18蛋白(參與UV-損傷DNA修復(fù)過程)。
Figure 5. 使用不同濃度(0, 50, 100 ppm)的致癌物MMS(一種烷化劑)處理HEK293細(xì)胞,然后分別使用Scanlater TRF法和化學(xué)發(fā)光法進(jìn)行檢測(cè)和結(jié)果對(duì)比(Stanford University)。
• 使用ScanLater Western Blot技術(shù)檢測(cè)痕量?jī)?nèi)源性的磷酸化的pChk1(參與UV & MMS-損傷DNA修復(fù)過程)。
Figure 6. 檢測(cè)分別使用致癌物MMS和UV輻射處理的HEK-293細(xì)胞中磷酸化的pChk1(Stanford University)。
• 使用ScanLater Western Blot技術(shù)檢測(cè)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程細(xì)胞刺激和抑制過程中產(chǎn)生的痕量?jī)?nèi)源性的磷酸化的JNK1蛋白;
Figure 7. 檢測(cè)刺激和抑制后的自然人類肺成纖維細(xì)胞(NHFL)中的磷酸化的JNK1蛋白 (結(jié)果來自試用客戶)。
總結(jié)
• 靈敏度:能夠檢測(cè)超低含量的人類細(xì)胞當(dāng)中的內(nèi)源性的磷酸化和泛素化的蛋白;
• 背景消除:銪元素時(shí)間分辨熒光標(biāo)記,具有超長(zhǎng)熒光壽命,至1ms級(jí),使用TRF檢測(cè)模式能夠極大地降低自發(fā)熒光和其他來源的背景噪聲;
• 節(jié)省時(shí)間:無需進(jìn)行ECL般的耗時(shí)優(yōu)化過程;
• 降低成本:不再需要成本高昂的X-射線膠片和顯影劑;
• 即插即用:可隨時(shí)在SpectraMax i3或SpectraMax Paradigm多功能酶標(biāo)儀上進(jìn)行高性能WB檢測(cè),極大地?cái)U(kuò)展了其在實(shí)驗(yàn)室研究方面的應(yīng)用。