Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,經(jīng)過(guò)PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體上,固相載體以非共價(jià)鍵形式吸附蛋白質(zhì),且能保持電泳分離的類型及其生物學(xué)活性不變。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對(duì)應(yīng)的抗體起免疫反應(yīng),再與或標(biāo)記的第二抗體起反應(yīng),經(jīng)過(guò)底物顯色或放射自顯影以檢測(cè)電泳分離的特異性目的基因表達(dá)的蛋白成分。該技術(shù)也廣泛應(yīng)用于檢測(cè)蛋白水平的表達(dá)。
關(guān)于Western Blot技術(shù),我們實(shí)驗(yàn)室憑著幾年來(lái)的豐富經(jīng)驗(yàn),總結(jié)出以下幾點(diǎn)建議:
1.抗體的選擇
對(duì)于國(guó)內(nèi)的大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室來(lái)講,做western blot實(shí)驗(yàn)選擇抗體是個(gè)頭疼的問(wèn)題。原因很簡(jiǎn)單,買進(jìn)口抗體捉襟見(jiàn)肘,買國(guó)產(chǎn)抗體得需要大無(wú)畏的勇氣。在我們實(shí)驗(yàn)室western blot實(shí)驗(yàn)歷程里,我們用過(guò)進(jìn)口抗體,進(jìn)口抗體國(guó)內(nèi)分裝包裝,國(guó)產(chǎn)抗體,質(zhì)量良莠不齊。 進(jìn)口抗體一般不會(huì)出現(xiàn)閃失:Abcam品種全,質(zhì)量過(guò)硬,但價(jià)高;Sigma的價(jià)最貴;比較有性價(jià)比的是CST的抗體,不足是CST的品種不多。Santa的多克隆抗體質(zhì)量可以,但是選用Santa的單抗還是有風(fēng)險(xiǎn),估計(jì)這也是業(yè)界共識(shí)了吧。
進(jìn)口抗體國(guó)內(nèi)分裝包裝我們也用過(guò)不少,大概好抗體的比例約為50%,如果能做出來(lái),也存在一個(gè)問(wèn)題,就是抗體大多只能用一次國(guó)產(chǎn)抗體比較知名的就幾家,但質(zhì)量確實(shí)不敢恭維。Western blot能做出來(lái)的確實(shí)不多,而且雜帶多,背景不干凈。
2. Western Blot實(shí)驗(yàn)條件
具體的試劑配方我們是按寶生物試劑冊(cè)的附錄部分配制轉(zhuǎn)移電泳緩沖液可以回收再用兩次。轉(zhuǎn)膜我們是300毫安/2小時(shí),轉(zhuǎn)膜一定得做冰水浴,就是把槽子泡在冰水混合液里。
3.關(guān)于奶粉,膜的選擇
奶粉看似簡(jiǎn)單,其實(shí)很重要,如果要湊合,可以到超市買脫脂奶粉。奶粉質(zhì)量不好,會(huì)最終導(dǎo)致顯影要么漆黑一片,要么啥都沒(méi)。我們現(xiàn)在用的BD的,很好很穩(wěn)定,可回收利用。 NC膜,PVDF膜我們都用過(guò), PVDF膜的好處是蛋白載量大,韌性好。唯一的麻煩是事先得用甲醇泡幾分鐘,目的是為了增強(qiáng)膜的正電荷。甲醇泡完后,得在轉(zhuǎn)移緩沖液里泡一兩分鐘。
4 .關(guān)于顯色液
我們選用進(jìn)口超敏ECL顯色液。用普通的顯色液檢測(cè)內(nèi)參一般都沒(méi)問(wèn)題,但對(duì)于表達(dá)量比較低的蛋白就不容易顯色出來(lái),而超敏的就不一樣,即使蛋白表達(dá)量很低,也可以檢測(cè)出來(lái)。
5. Western Blot實(shí)驗(yàn)關(guān)鍵
Western Blot操作步驟多,每一步的失誤都會(huì)造成全盤(pán)失敗,綜合而言,抗體仍然是決定成敗的關(guān)鍵,如果抗體不好,就是神仙也沒(méi)招。其中內(nèi)參抗體很重要,因?yàn)閮?nèi)參抗體的選擇關(guān)系到全盤(pán)實(shí)驗(yàn)的考評(píng)。Actin,Tubulin,GAPDH我們都用過(guò),Actin,Tubulin的缺點(diǎn)是有時(shí)候會(huì)出現(xiàn)復(fù)帶,比較穩(wěn)定的還是GAPDH。如果用心看看cell,nature,science上的文章,大多用GAPDH做內(nèi)參。進(jìn)口的,國(guó)內(nèi)分裝的,國(guó)產(chǎn)的,我們都用過(guò),效果都還可以。
從western實(shí)驗(yàn)我們總結(jié)出,實(shí)驗(yàn)上根本省不下來(lái)錢,一個(gè)環(huán)節(jié)的爛貨就會(huì)導(dǎo)致全盤(pán)失敗。對(duì)于實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)而言,也是如此,一個(gè)步驟的疏忽會(huì)導(dǎo)致整個(gè)實(shí)驗(yàn)立題和評(píng)估的邏輯混亂。如果要追求性價(jià)比,也就是如何發(fā)揮窮人的勞斯萊斯的最大收益,那從一開(kāi)始就要按秋后算賬的原則選擇試劑,要算總賬;如果要讓實(shí)驗(yàn)順順利利,那就得注意每一個(gè)環(huán)節(jié),步步為營(yíng),細(xì)節(jié)決定成敗。到現(xiàn)在,只要抗體work,幾乎沒(méi)有我們做不出來(lái)的分子,Western給了我們無(wú)窮的自信。
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