為了支持新型冠狀病毒(COVID-19)的檢測(cè)及疫苗研發(fā)工作,美國(guó)疾病預(yù)防控制中心(CDC)和中國(guó)政府都已完成了新型冠狀病毒基因組的測(cè)序并將結(jié)果提交至US NCBI GenBank® 數(shù)據(jù)庫(kù)
[1]。近日,IDT收到了來(lái)自世界各地研究人員關(guān)于新型冠狀病毒檢測(cè)試劑盒的詢問(wèn),以下是部分簡(jiǎn)要說(shuō)明。
美國(guó)疾病預(yù)防控制中心
美國(guó)疾病預(yù)防控制中心檢測(cè)試劑盒* 靶向COVID-19核衣殼蛋白基因(N-基因)上的不同位點(diǎn)。該試劑盒中的3組引物/探針必須與靶向人RNase P基因的內(nèi)部對(duì)照同時(shí)運(yùn)行。每個(gè)患者樣本
共需進(jìn)行4次qPCR檢測(cè)。
1. 該檢測(cè)試劑盒采用一步法qPCR反應(yīng)(即逆轉(zhuǎn)錄和后續(xù)qPCR反應(yīng)在同一步驟中完成);
2. 所有3次N-基因檢測(cè)只有在Cq <35時(shí)方可視為陽(yáng)性結(jié)果;
3. RNase P內(nèi)部對(duì)照反應(yīng)是關(guān)鍵。Cq >35表示樣本提取不佳,需要重復(fù)實(shí)驗(yàn);
敬請(qǐng)查閱最新的美國(guó)疾病預(yù)防控制中心 COVID-19 RT-PCR檢測(cè)方法實(shí)驗(yàn)室指南,獲取相關(guān)文檔及實(shí)驗(yàn)方案。
與其他檢測(cè)試劑盒的比較
世界衛(wèi)生組織(WHO)
世界衛(wèi)生組織實(shí)驗(yàn)方案不同于美國(guó)疾病預(yù)防控制中心實(shí)驗(yàn)方案。世界衛(wèi)生組織建議需進(jìn)行
3次qPCR反應(yīng)來(lái)確認(rèn)是否感染COVID-19。盡管這是一套完整的實(shí)驗(yàn)方案,但沒(méi)有美國(guó)疾病預(yù)防控制中心檢測(cè)方法來(lái)得快,因?yàn)樗枰B續(xù)進(jìn)行3次檢測(cè),且必須觀察到陽(yáng)性結(jié)果才能進(jìn)行下一次檢測(cè)。該實(shí)驗(yàn)方案按如下順序進(jìn)行檢測(cè):
1. 冠狀病毒E-基因
2. RdRP基因:針對(duì)SARS 冠狀病毒和其他蝙蝠相關(guān)冠狀病毒
3. RdRP基因:針對(duì)COVID-19
中國(guó)疾病預(yù)防控制中心
中國(guó)疾病預(yù)防控制中心檢測(cè)試劑盒建議
采用2組引物/探針。第1組靶向
ORF 1ab,第2組用于確認(rèn)COVID-19的N-基因。
對(duì)照組
初步的電子模擬分析表明,搭配使用 IDT N-基因陽(yáng)性對(duì)照組模板**與美國(guó)疾病預(yù)防控制中心檢測(cè)試劑盒,與使用中國(guó)疾病預(yù)防控制中心、泰國(guó)衛(wèi)生部以及HKU的引物/探針組進(jìn)行類(lèi)似實(shí)驗(yàn)獲得的結(jié)果相符。當(dāng)然,這是基于電子模擬研究,建議用戶在自己的實(shí)驗(yàn)室中對(duì)所選試劑盒進(jìn)行驗(yàn)證。
如需了解更多信息,請(qǐng)登錄
http://www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents
參考文獻(xiàn)
1. (2020) 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China. [Online] US Centers for Disease Control and Prevention. [Accessed 28 Jan 2020].
* IDT并非、也未聲稱是美國(guó)疾病預(yù)防控制中心冠狀病毒引物探針序列的主要、首選或推薦供應(yīng)商。IDT可獨(dú)立提供CDC公布的用于冠狀病毒檢測(cè)的引物和探針序列,訂購(gòu)非常方便。
** IDT對(duì)照并非由CDC設(shè)計(jì)、檢測(cè)和驗(yàn)證,也未得到CDC或其他公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)的認(rèn)可。這些對(duì)照由IDT單獨(dú)設(shè)計(jì),針對(duì)SARS、MERS和COVID-19的核衣殼蛋白全基因,是為了方便客戶而提供的。如果用于解釋檢測(cè)結(jié)果,最終用戶應(yīng)進(jìn)行對(duì)照驗(yàn)證。
用于2019新型冠狀病毒(COVID-19)檢測(cè)的IDT試劑
COVID-19 qPCR探針
IDT可提供美國(guó)疾病預(yù)防控制中心* 設(shè)計(jì)的4次COVID-19檢測(cè)試劑盒,用于病毒鑒定。3次檢測(cè)靶向COVID-19核衣殼蛋白基因(N-基因)上的不同位點(diǎn)。第4次內(nèi)部對(duì)照檢測(cè)靶向人RNase P基因,必須同時(shí)運(yùn)行。
該試劑盒遵循ISO 13485:2016標(biāo)準(zhǔn)生產(chǎn),其中包含引物和5’ FAM / 3’ Black Hole Quencher® (BHQ) 探針,溶于IDTE (pH 7.5) 中,并于1–2個(gè)工作日內(nèi)發(fā)貨,在常溫下進(jìn)行運(yùn)輸。
產(chǎn)品 |
貨號(hào) |
2019-nCoV試劑盒,50 rxn |
10006604 |
2019-nCoV試劑盒,100 rxn |
10006605 |
2019-nCoV試劑盒,500 rxn |
10006606 |
COVID-19質(zhì)粒對(duì)照組
IDT還可提供COVID-19對(duì)照質(zhì)粒**,其中包括COVID-19、SARS或MERS的核衣殼蛋白全基因。COVID-19 CDC qPCR探針靶向nCoV核衣殼蛋白基因區(qū)域,該基因存在于COVID-19_N陽(yáng)性對(duì)照質(zhì)粒中。Hs_RPP30陽(yáng)性對(duì)照試劑盒包含一部分
RPP30基因,它是人類(lèi)基因組中的單拷貝基因。對(duì)照質(zhì)粒溶于250 µL(200,000個(gè)拷貝/µL)的IDTE(pH 8.0)中,并于1–2個(gè)工作日內(nèi)發(fā)貨,在常溫下進(jìn)行運(yùn)輸。
產(chǎn)品 |
貨號(hào) |
2019-nCoV_N陽(yáng)性對(duì)照 |
10006625 |
Hs_RPP30陽(yáng)性對(duì)照 |
10006626 |
MERS-CoV對(duì)照 |
10006623 |
SARS-CoV對(duì)照 |
10006624 |
這些產(chǎn)品僅供研究使用 (RUO)。
(如需最新的US CDC檢測(cè)方法相關(guān)文檔及實(shí)驗(yàn)方案,請(qǐng)登錄
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/index.html)
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關(guān)于IDT
Integrated DNA Technologies, Inc. (IDT) 致力于面向生命科學(xué)界開(kāi)發(fā)、生產(chǎn)并銷(xiāo)售核酸產(chǎn)品,用于學(xué)術(shù)與商業(yè)研究、農(nóng)業(yè)、醫(yī)療診斷、藥物開(kāi)發(fā)等領(lǐng)域。IDT開(kāi)發(fā)了多項(xiàng)針對(duì)基因組應(yīng)用的專利技術(shù),如新一代測(cè)序、CRISPR基因組編輯、合成生物學(xué)、數(shù)字PCR以及RNA干擾。憑借GMP服務(wù),研究人員可利用IDT產(chǎn)品針對(duì)多種癌癥以及大多數(shù)遺傳性和傳染性疾病進(jìn)行診斷檢測(cè)。作為定制核酸生產(chǎn)領(lǐng)域的行業(yè)領(lǐng)軍者,IDT為超過(guò)130,000名生命科學(xué)研究人員提供服務(wù)。IDT生產(chǎn)總部位于美國(guó)愛(ài)荷華州科勒爾維爾,并在美國(guó)加利福尼亞州圣地亞哥、比利時(shí)魯汶以及新加坡設(shè)有生產(chǎn)工廠。