GeneMill 合成生物學服務中心(GeneMill Synthetic Biology services),位于英國利物浦大學,成立于2016年,是英國也是世界著名的創(chuàng)新型合成生物學開放式自動化服務中心。該服務中心能夠提供高通量的載體構建、DNA合成、基因組編輯(CRIPSR/Cas9,TALENs),蛋白設計和表達體系(涵蓋細菌、酵母、植物、動物細胞等多種體系),代謝/蛋白檢測等各種服務。
坐落于英國利物浦大學內的GeneMill
01 合成生物學是什么?
簡單來說,合成生物學 (Synthetic Biology)是將標準化的工程技術應用于生物學,以此創(chuàng)造出新型或具有特定功能的生命體或生物系統(tǒng),以滿足需求。合成生物學是21世紀生物科領域新興的一門學科,是結合工程系、細胞生物學、進化系統(tǒng)學、生物化學、信息學、數(shù)學和計算機等多學科交叉的產(chǎn)物。
2014年,美國國防部將其列為21世紀優(yōu)先發(fā)展的六大顛覆性技術之一;英國商業(yè)創(chuàng)新技能部將合成生物技術列為未來的八大技術之一;近年來,合成生物學發(fā)展迅速,國內著名的合成生物自動化平臺主要包括:深圳先進技術研究院、天津工業(yè)生物技術研究所、天津大學化工學院,國家蛋白質科學中心、武漢生物技術研究院和華大生命科學研究院等等。
設計與合成可預測的生命體,是合成生物學的核心問題
02 GeneMill 合成生物學workflow
1、DNA constructs設計:利用計算機模擬(in silicon);
2、DNA parts 合成:通過GeneArts和Twist 公司合成并存儲在Micronic™ 2D條碼管;
3、DNA parts的保存和挑。篠PT Labtech 公司的-80℃ arktic 自動化樣本存儲系統(tǒng);
4、納升級的DNA 組分combine:SPT Labtech公司的納升級移液工作站 mosquito X1 (25-1200 nL);
5、組裝:Cybio Felix;
6、高通量克隆篩選和挑。篕biosystems公司的K6-2;
7、質控 (QC):Qiagen和Agilent的自動化凝膠電泳;
8、分析:代謝組分析-RoboLector from M2P labs;生化分析-BioTek 酶標儀
GeneMill 合成生物學中心workflow
03 騰泉的合成生物學解決方案:DNA存儲→cherry pick→組裝→克隆挑取
在GeneMill的整個合成生物學的工作流程中,騰泉生物和母公司及其合作伙伴的技術產(chǎn)品被廣泛應用到了DNA parts分裝、存儲,快速挑取,組裝,克隆篩選等多個關鍵應用。
如下圖所示,GeneMill將DNA parts存儲在英國SPT Labtech公司(前身為TTP Labtech)的-80℃氣動式全自動樣本存儲系統(tǒng)arktic中,占地僅1.08㎡的arktic可存儲多達14萬根樣品管,最快6.25秒即可完成任意單管的cherry pick,顯著提高了GeneMill的整個工作流程的效率。Cherry pick后的DNA parts被保存在荷蘭Micornic公司的2D條碼管中,通過SPT Labtech公司的納升級分液設備mosquito X1 (25 nL-1200 nL) 將微量的DNA parts以及master mix等試劑轉移到DNA assembly反應板中。
SPT Labtech公司產(chǎn)品在GeneMill中的流程
此外,騰泉的合作伙伴英國Kbiosystems公司 (全球第一家全自動克隆挑取設備的生產(chǎn)商),提供了高通量克隆篩選和挑取機器人K6-2, 幫助GeneMill每天完成至少10000個克隆挑取和篩選。
K6-2 全自動克隆挑取系統(tǒng)
04 結束語
來自騰泉生物的母公司英國SPT Labtech及其合作伙伴英國KBiosystmes公司和荷蘭Micronic公司的技術產(chǎn)品為GeneMill提供了一個高通量、納升級assemble規(guī)模和全自動化的合成生物學解決方案,提高了GeneMill整個流程的可重復性和標準化,同時大大節(jié)省了試劑耗材和項目的周期。
相關的技術產(chǎn)品見下:
參考文獻
Johnson, James R., “GeneMill:A 21st century platform for innovation.” Biochemical Society Transactions 44, no. 3 (2016): 681-683.
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