English | 中文版 | 手機(jī)版 企業(yè)登錄 | 個(gè)人登錄 | 郵件訂閱
當(dāng)前位置 > 首頁(yè) > 技術(shù)文章 > 虛擬篩選、高通量實(shí)驗(yàn)篩選化合物庫(kù)

虛擬篩選、高通量實(shí)驗(yàn)篩選化合物庫(kù)

瀏覽次數(shù):1066 發(fā)布日期:2021-10-19  來(lái)源:MedChemExpress
 

Kynurenine Pathway Library 

 

 (含12,300種化合物)

靶向犬尿氨酸代謝途徑關(guān)鍵酶的新型化合物庫(kù)

KynureninePathway (犬尿氨酸途徑, KP)是色氨酸代謝的主要途徑,參與多個(gè)病理、生理過(guò)程。研究發(fā)現(xiàn)阿爾茨海默病、帕金森氏癥等多種神經(jīng)退行性疾病中的 KP 代謝產(chǎn)物水平有明顯變化。KP 作為防治神經(jīng)退行性疾病的治療靶點(diǎn)已引起人們的廣泛關(guān)注。Kynurenine Pathway Library 是通過(guò)分子對(duì)接、藥效團(tuán)模型匹配等精心挑選的化合物庫(kù),庫(kù)中化合物靶向犬尿氨酸代謝關(guān)鍵酶:indoleamine dioxygenase (IDO)、tryptophandioxygenase (TDO)、3-hydroxyanthranilic acid dioxygenase(3-HAO)等。 

Fig 1. IDO1 活性位點(diǎn)示意圖:左上為 2D0T (PDB ID),左下為 4PK5 (PDB ID),

右圖為用于分子對(duì)接的 Pocket-A、Pocket-B。

Protein Mimetics Library  

(含8,960種化合物)

蛋白基序模擬物庫(kù)
針對(duì)蛋白質(zhì)相互作用 (PPI)的藥物設(shè)計(jì)為疾病治療提供了廣泛的平臺(tái)和新的思路,是近年來(lái)藥物發(fā)現(xiàn)研究的熱點(diǎn)和重點(diǎn)。PPI 小分子抑制劑設(shè)計(jì)的關(guān)鍵點(diǎn)在于使小分子具有底物蛋白相互作用的特征,如模擬蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu):α-螺旋、β-折疊和 β-轉(zhuǎn)角。研究發(fā)現(xiàn)大多數(shù) PPI 作用都由被稱為 ”hot spot” 的熱點(diǎn)殘基形成。以熱點(diǎn)殘基為起點(diǎn)來(lái)進(jìn)行配體發(fā)現(xiàn)是 PPI 抑制劑設(shè)計(jì)中最為常用和有效的方法。通過(guò)分析熱點(diǎn)殘基、使用 ”three residue”等方法,Protein Mimetics Library 精選了可模仿常見(jiàn)蛋白基序的化合物。
 

 

Fig 2. Protein Mimetics Library 中化合物舉例:α-螺旋 (上)、β-轉(zhuǎn)角 (下)模擬物。

RNA Library 

(含9,070種化合物)

可能結(jié)合 RNA 的化合物庫(kù)
作為生命體“中心法則”的樞紐,RNA 不僅是基因表達(dá)的調(diào)控因子,而且具有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)合成的能力。RNA 的調(diào)節(jié)異常會(huì)引發(fā)各種不同的人類疾病。以 RNA 為靶點(diǎn)進(jìn)行藥物設(shè)計(jì)越來(lái)越引起人們的關(guān)注,在腫瘤治療和病毒控制等疾病中顯示出了誘人的應(yīng)用前景。RNA Library 通過(guò)藥效團(tuán)匹配、結(jié)構(gòu)相似性搜索等方法精選了與能 RNA 二級(jí)結(jié)構(gòu)產(chǎn)生相互作用的化合物。

Fig 3. RNA Library 中化合物舉例

Tubulin Library

(含3,454種化合物) 

靶向微管蛋白的化合物庫(kù)
微管 (tubulin)是真核細(xì)胞中普遍存在且獨(dú)有的管狀細(xì)胞器結(jié)構(gòu),是細(xì)胞骨架的重要組成部分,在有絲分裂過(guò)程中起重要作用。抗微管類藥物是一類以細(xì)胞微管蛋白為作用靶點(diǎn)的藥物,通過(guò)抑制細(xì)胞的有絲分裂過(guò)程而產(chǎn)生抗腫瘤活性。Tubulin Librarys 是通過(guò)分子對(duì)接、2D 相似性和拓?fù)漕愃莆锼阉、使用分子和結(jié)構(gòu)過(guò)濾器等精選的 3,454 種靶向微管蛋白的化合物庫(kù)。

以上化合物庫(kù)可以整庫(kù)用于高通量實(shí)驗(yàn)篩選;也可以在 MCE 虛擬篩選后,選擇部分高分化合物組庫(kù)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

來(lái)源:上海皓元生物醫(yī)藥科技有限公司
聯(lián)系電話:021-58955995
E-mail:sales@medchemexpress.cn

用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊(cè) 忘記密碼
評(píng)論只代表網(wǎng)友觀點(diǎn),不代表本站觀點(diǎn)。 請(qǐng)輸入驗(yàn)證碼: 8795
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網(wǎng) 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com