TMT(Tandem Mass Tag)是一種廣泛應(yīng)用于定量蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù)。TMT是一種化學(xué)標(biāo)記方法,用于定量蛋白質(zhì)組學(xué)。不同樣本的肽段會被不同的等同位素標(biāo)簽標(biāo)記。這些標(biāo)簽在質(zhì)譜中具有相同的質(zhì)量,但當(dāng)它們在質(zhì)譜儀中被分解時,會釋放不同的報告離子。通過比較這些報告離子的強度,可以確定肽段在不同樣本中的相對豐度。
圖1. 基于TMT的蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)工作流程
1、優(yōu)勢:
多路復(fù)用:可以同時分析多個樣本,從而加速實驗流程并減少實驗變異性。
精確度:由于使用了特定的標(biāo)簽,可以提高肽段的識別準(zhǔn)確性。
寬廣的動態(tài)范圍:適用于檢測豐度差異大的蛋白質(zhì)。
2、局限性:
成本:與無標(biāo)簽方法相比,化學(xué)標(biāo)記可能增加實驗的成本。
比率壓縮:可能由于不完全的離子隔離或干擾物種的共同隔離引起。
樣本處理:需要更多的樣本處理步驟,可能導(dǎo)致樣本損失或引入實驗偏差。
3、應(yīng)用:
TMT技術(shù)廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究,特別是在需要定量比較不同條件或處理下的樣本時,如疾病研究、藥物作用機制研究等。