MANTIS和TEMPEST液體處理器在COVID-19 測(cè)試工作流程中的應(yīng)用

自動(dòng)化有一系列好處，包括提高可重復(fù)性和減少實(shí)驗(yàn)室工作人員的接觸
 

隨著世界各地的實(shí)驗(yàn)室應(yīng)對(duì)篩選大量 SARS-CoV-2 樣本的挑戰(zhàn)，這些實(shí)驗(yàn)室的管理人員已轉(zhuǎn)向使用自動(dòng)化來解決一些關(guān)鍵問題。

無論這些實(shí)驗(yàn)室的規(guī)模是國(guó)家級(jí)別的，每天處理數(shù)十萬個(gè)樣本，還是在組織層面的小規(guī)模和敏捷實(shí)驗(yàn)室測(cè)試，在這些工作流程中都有適應(yīng)自動(dòng)化的一席之地。在流程中實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化帶來了一些顯著的優(yōu)勢(shì)。通過減少手動(dòng)操作步驟的次數(shù)，可提高可重復(fù)性。由于手工進(jìn)行的步驟較少，這也減少了實(shí)驗(yàn)室工作人員的潛在接觸。

挑戰(zhàn): 許多實(shí)驗(yàn)室同時(shí)啟動(dòng) COVID-19 篩查計(jì)劃的需求導(dǎo)致移液器吸頭和試劑等資源稀缺。實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化為測(cè)試和篩選過程帶來了顯著的好處，但由于高通量?jī)x器使用了大量的這些耗材，這一問題會(huì)進(jìn)一步惡化。
 
解決方法: 使用小型、靈活的液體處理解決方案，不依賴一次性吸頭，并且可以幾乎消除因死體積過大而造成的試劑浪費(fèi)，使實(shí)驗(yàn)室管理人員能夠從自動(dòng)化的優(yōu)勢(shì)中獲益，并減少對(duì)稀缺資源的依賴。 
 
FORMULATRIX®的MANTIS®和TEMPEST®液體處理器背后的技術(shù)是獨(dú)一無二的，使用的是基于正位移微隔膜的芯片。這意味著試劑可以直接分配到用于樣品制備和 qPCR 分析的 96 或 384 孔板和深孔模塊中，而無需一次性塑料移液器吸頭。由于這些液體處理器的最小分配體積分別僅為100 nL 和 200 nL，這也為通過小型化減少總反應(yīng)體積開辟了道路，從而省下了寶貴的試劑。
 

 
 
在下面的示例中，我們重點(diǎn)介紹了三個(gè)不同實(shí)驗(yàn)室使用MANTIS 液體處理器的經(jīng)驗(yàn)。
 
牛津大學(xué) Weatherall 分子醫(yī)學(xué)研究所、根特生物技術(shù)公司 Biogazelle 和利物浦大學(xué)蛋白質(zhì)組研究中心。
 
 Neil Ashley博士，Wimthell分子醫(yī)學(xué)研究所（WMM）在英國(guó)牛津的單細(xì)胞核心設(shè)施管理者提出了SARS COV-2 qPCR工作流程，在夏季時(shí)這一流程已經(jīng)在其設(shè)施上操作了。
 
在Neil 的網(wǎng)絡(luò)研討會(huì)中，他討論了使用MANTIS作為工作流程的一部分，強(qiáng)調(diào)了所用移液器吸頭數(shù)量的減少以及其整體反應(yīng)規(guī)模的成功小型化。通過將MANTIS 液體處理器集成到用于 COVID-19 測(cè)試的現(xiàn)有 RT-qPCR 工作流程中，一致且可靠的非接觸式分配提高了吞吐量并消除了對(duì)制造商專有吸頭的依賴，這意味著全球供應(yīng)短缺不再是阻止RT-qPCR檢測(cè)以所需容量運(yùn)行的障礙。
 
MANTIS 液體處理器在減少化驗(yàn)量、顯著節(jié)省成本以及幫助避免試劑短缺時(shí)的延誤等方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。 
 
Jo Vandesompele教授是根特大學(xué)醫(yī)學(xué)與健康科學(xué)學(xué)院功能基因組學(xué)和應(yīng)用生物信息學(xué)的研究教授，也是Biogazole公司的聯(lián)合創(chuàng)始人環(huán)境中提供RNA和DNA生物標(biāo)記物服務(wù)。
 
2020年4月，Biogazole推出了一個(gè)高通量、模塊化和可擴(kuò)展的SARS-CoV-2 RT qPCR測(cè)試平臺(tái)，每天處理多達(dá)6000個(gè)患者樣本。診斷測(cè)試是在ISO17025質(zhì)量管理體系下進(jìn)行的，該體系要求新儀器根據(jù)具有嚴(yán)格驗(yàn)收標(biāo)準(zhǔn)的預(yù)定義計(jì)劃進(jìn)行驗(yàn)證。
 

 
Biogazelle 選擇 MANTIS 作為其診斷 SARS-CoV-2 RT-qPCR 測(cè)試中的自動(dòng)液體處理器，因?yàn)樗�占地面積小、靈活且高速準(zhǔn)確分配。除了儀器的技術(shù)能力外，易于使用的軟件可確保在篩選過程中以最低的培訓(xùn)要求快速部署。完整的應(yīng)用說明和網(wǎng)絡(luò)研討會(huì)詳細(xì)介紹了 Biogazelle 團(tuán)隊(duì)為將 MANTIS 納入其 ISO 17025 認(rèn)可實(shí)驗(yàn)室而開展的工作，可以在 FORMULATRIX 網(wǎng)站上找到關(guān)于這個(gè)的相關(guān)信息。
 
Ed Emmott 教授是利物浦大學(xué)蛋白質(zhì)組研究中心 Emmott 實(shí)驗(yàn)室的負(fù)責(zé)人。該實(shí)驗(yàn)室的目標(biāo)是使用和開發(fā)蛋白質(zhì)組學(xué)方法來研究 RNA 病毒復(fù)制和病毒-宿主相互作用，特別是使用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)來幫助這項(xiàng)研究。隨著對(duì)有效SARS-CoV-2疫苗的爭(zhēng)奪 持續(xù)吸引公眾和制藥行業(yè)的關(guān)注，認(rèn)識(shí)到在進(jìn)一步了解病毒與宿主相互作用方面的并行研究工作是很重要的，因?yàn)檫@可能會(huì)發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)。
Emmott 實(shí)驗(yàn)室正在使用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)，遵循SCoPE2 協(xié)議，對(duì) COVID-19 病毒進(jìn)行基礎(chǔ)研究。與之前的單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)相比，由于試劑使用的顯著小型化和用量減少，以及更短的實(shí)際操作時(shí)間，加上樣品制備和測(cè)量的吞吐量顯著加，SCoPE2的成本因而降低了。在最近的一份應(yīng)用說明中，Ed 討論了 MANTIS 液體處理器如何對(duì)這一成功起到關(guān)鍵作用：
MANTIS 提供了亞微升體積的可靠分配，即便是分配非常困難的液體類別，如用于存儲(chǔ)串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽（TMT）的100%乙腈。
 
通過將MANTIS和TEMPEST液體處理器納入其COVID-19 測(cè)試工作流程，世界各地的許多實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)認(rèn)識(shí)到這些顯著優(yōu)勢(shì)。