Origins高分辨率潛水電泳儀助力病原微生物流行病學研究

【Microorganisms】Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia
在斯洛伐克城市、農業(yè)和洞穴棲息地中，蓖麻硬蜱對伯氏疏螺旋體復合體感染率的時空特異性

萊姆病(Lyme borreliosis ，LB)是歐洲最常見的蜱傳人類感染性疾病，近幾十年來發(fā)病率不斷上升。該病以蜱為媒介，由伯氏疏螺旋體(Bbsl)所致的自然疫源性疾病。在歐洲全域，特別是斯洛伐克，已觀察到大量的蓖麻硬蜱種群，成為病原體伯氏疏螺旋體(Bbsl)復合體的主要媒介。了解感染性疾病的傳播途徑對實施有效的控制措施至關重要。

本研究聚焦于斯洛伐克，從代表城市/郊區(qū)、自然和農業(yè)棲息地的三個地點尋找感染伯氏疏螺旋體(Bbsl)的蓖麻硬蜱種群，調查Bbsl的感染率及其物種多樣性的時空特異性。在布拉迪斯拉發(fā)鎮(zhèn)(城市/郊區(qū)棲息地)、小喀爾巴阡山脈(自然棲息地)和斯洛伐克東部農業(yè)棲息地，通過拖拽植被采集蓖麻硬蜱若蟲和成蟲。用聚合酶鏈式反應檢測蜱體內是否存在疏螺旋體，并用限制性片段長度多態(tài)性（RFLP）鑒定Bbsl種群。用反向線性印跡法（Reverse Line Blotting ，RLB）鑒定共感染蜱中的伯氏疏螺旋體類型，從而獲得不同環(huán)境中蓖麻硬蜱攜帶伯氏疏螺旋體的真實情況。

文中使用限制性片段長度多態(tài)性（RFLP）分析鑒定Bbsl種群類型，具體通過Origins高分辨率潛水電泳儀結合Spreadex gel EL300 mini預制膠，以核酸片段分布圖譜確定Bbsl種群及亞種。

在探索的棲息地中，蜱蟲感染伯氏疏螺旋體在空間和時間上存在顯著差異�？偢腥韭首畹偷氖浅鞘�/郊區(qū)棲息地，而自然和農業(yè)棲息地的感染率較高。RFLP在每個環(huán)境類型中檢測到6種Bbsl，包括B. burgdorferi sensu stricto (s.s.)， B. afzelii， B. garinii， B. valaisiana，B. lusitaniae 和 B. spielmanii。其中，共感染占總感染數(shù)量的3%。通過RLB和測序鑒定出B. kurtenbachii與B. burgdorferi s.s，B. garinii 和B. valaisiana存在共感染的情況。這是首次在斯洛伐克和歐洲的蓖麻硬蜱調研中發(fā)現(xiàn)B.kurtenbachii。同時在若蟲和成蟲之間、不同年份之間以及不同生物環(huán)境類型之間，發(fā)現(xiàn)了Bbsl物種比例的變化。在城市棲息地相對距離較短的地點之間，Bbsl物種的流行模式和比例也存在空間差異。伯氏疏螺旋體感染率和分布的時空特異性可能與當?shù)丨h(huán)境條件和脊椎動物宿主譜有關。由于存在對人類致病的伯氏疏螺旋體類型，所有探索的地點都可以被列為具有高流行病學風險的地區(qū)。

Kazimírová, Mária, et al. "Spatial and Temporal Variability in Prevalence Rates of Members of the Borrelia burgdorferi Species Complex in Ixodes ricinus Ticks in Urban, Agricultural and Sylvatic Habitats in Slovakia." Microorganisms 11.7 (2023): 1666.

Origins高分辨率潛水電泳來自奧地利AL-Labortechnik公司，集成了整體的溫度控制系統(tǒng)，即通過半導體元件和自動溫度控制系統(tǒng)，精準控制電泳過程中的溫度。同時整合循環(huán)泵系統(tǒng)，確保整個電泳區(qū)域溫度和pH值恒定，形成均勻的、線性電場，這使得該設備具有高分辨率和高重復性，可廣泛用于植物、微生物物種的分群和鑒定，以及疾病相關基因的研究等。

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