文獻(xiàn)分享：2024年度Clinx勤翔成像系統(tǒng)海外科研用戶發(fā)表應(yīng)用文獻(xiàn)摘要

自2006年成立以來(lái)，Clinx勤翔成像系統(tǒng)已在30多個(gè)國(guó)家安裝了5,000多臺(tái)設(shè)備。其用戶遍布不同的機(jī)構(gòu)，包括科研實(shí)驗(yàn)室、醫(yī)療設(shè)施和學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)。在剛過(guò)去的2024年里，Clinx勤翔成像系統(tǒng)同樣在助力海外科研人員日常研究中穩(wěn)定發(fā)揮。 本次，我們整理了2024年度海外科研用戶使用Clinx勤翔成像儀器已發(fā)表的部分文獻(xiàn)摘要與大家分享。

丨IQGAP3 Is an Important Mediator of Skin Inflammatory Diseases
研究單位：俄羅斯科學(xué)院瓦維洛夫普通遺傳學(xué)研究所，功能基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室
 
摘要： IQGAP3 (IQ Motif Containing GTPase Activating Protein 3) 是支架蛋白IQGAP家族的成員。先前的研究表明，IQGAP3在銀屑病皮損中過(guò)度表達(dá)。考慮到它參與了細(xì)胞增殖和趨化因子信號(hào)傳導(dǎo)等過(guò)程，我們?cè)噲D探索其在驅(qū)動(dòng)角化細(xì)胞銀屑病表型中的分子作用。通過(guò)對(duì)HaCaT角質(zhì)形成細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析，我們發(fā)現(xiàn)了當(dāng)IQGAP3被敲除時(shí)，許多與銀屑病相關(guān)的通路受到影響。其中包括NFkB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)，EGFR信號(hào)，p38/MAPK和ERK1/ERK2的激活，脂質(zhì)代謝，細(xì)胞因子的產(chǎn)生，以及對(duì)炎癥細(xì)胞因子刺激的反應(yīng)。實(shí)時(shí)分析進(jìn)一步揭示了細(xì)胞生長(zhǎng)動(dòng)力學(xué)的變化，包括增殖和傷口愈合。細(xì)胞增殖和凋亡之間的平衡被改變，皮膚屏障功能和IL-6和IFNy的產(chǎn)生也發(fā)送了變化，盡管有這些重要發(fā)現(xiàn)，但在基因敲除細(xì)胞中觀察到的變化的多樣性使我們得出結(jié)論，IQGAP3可能不是治療抑制使銀屑病中角質(zhì)形成細(xì)胞表型正�；�的最佳靶點(diǎn)。
Doi：10.3390/ijms25084545

丨Mitochondrial dynamics and sex-specific responses in the developing rat hippocampus: Effect of perinatal asphyxia and mesenchymal stem cell Secretome treatment
研究單位： 智利大學(xué)醫(yī)學(xué)系 ICBM 分子與臨床藥理學(xué)項(xiàng)目
 
摘要： 圍產(chǎn)期窒息是新生兒出生時(shí)死亡的主要原因之一。幸存者可以進(jìn)步，但經(jīng)常遭受長(zhǎng)期后遺癥。我們旨在確定圍產(chǎn)期窒息對(duì)線粒體動(dòng)力學(xué)的影響，以及間充質(zhì)干細(xì)胞分泌組（MSC-S）治療是否可以減輕有害影響。  

本研究發(fā)現(xiàn)圍產(chǎn)期窒息是新生兒出生時(shí)死亡的主要原因之一。幸存者可以進(jìn)步，但經(jīng)常遭受長(zhǎng)期后遺癥。我們旨在確定圍產(chǎn)期窒息對(duì)線粒體動(dòng)力學(xué)的影響以及間充質(zhì)干細(xì)胞分泌組（MSC-S）治療是否可以減輕有害影響。

該研究為圍產(chǎn)期窒息對(duì)發(fā)育中大腦線粒體動(dòng)力學(xué)的影響以及間充質(zhì)干細(xì)胞分泌組治療提供的治療機(jī)會(huì)提供了新的見(jiàn)解。它還強(qiáng)調(diào)了將性別視為圍產(chǎn)期腦損傷和治療發(fā)展中的生物變量的相關(guān)性。這些發(fā)現(xiàn)有助于為受圍產(chǎn)期窒息影響的嬰兒開(kāi)發(fā)有針對(duì)性的個(gè)性化治療。
Doi：10.1016/j. bBamcr.2024.119851

丨Gastrointestinal helminthiasis among Nigerian farmers in Delta North communities
研究單位： 尼日利亞阿布拉卡三角洲州立大學(xué)理學(xué)院動(dòng)物與環(huán)境生物學(xué)系
 
摘要：這項(xiàng)研究確定了六種寄生蟲(chóng)，即， 曼氏血吸蟲(chóng)，鉤蟲(chóng)， 毛蟲(chóng)，蚯蚓腸蟲(chóng)和刺圓線蟲(chóng)， 總流行率為21.6%。淡水沼澤林6種寄生蟲(chóng)的流行率（21.8%）略高于低地雨林5種寄生蟲(chóng)的流行率（21.0%），但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（磷 >0.05）。影響疾病傳播的因素包括性別、年齡、行為、感染類型、文化和環(huán)境，兒童和女性的脆弱性更高（磷 <0.05）。使用Kato Katz方法和PCR進(jìn)行比較的附加調(diào)查 曼氏血吸蟲(chóng) 120份樣品的121 bp引物顯示Kato Katz的患病率為0.0%，PCR的患病率為4.2%。這項(xiàng)研究揭示了在間歇性大規(guī)模驅(qū)蟲(chóng)給藥的地區(qū)持續(xù)的胃腸蠕蟲(chóng)感染。這強(qiáng)調(diào)了在農(nóng)業(yè)社區(qū)綜合控制胃腸蠕蟲(chóng)病的必要性。
Doi： 10.4103/ohbl.ohbl_40_23

丨Valorization of rice straw and vascular aquatic weeds for sustainable prebiotic hemicellulosic autohydrolysate production: Extraction, characterization and fermentability
研究單位： 印度克什米爾大學(xué)發(fā)展研究中心
 
摘要：這項(xiàng)研究描述了從稻草（RS）和水生植物如香蒲（TA）和水葫蘆（CD）中提取和表征半纖維素自水解物（HAHs）的過(guò)程，并進(jìn)一步探索了它們支持從牛奶樣本中分離出的特定乳酸菌（即益生元活性）增殖的能力。研究使用熱水提取法（HWE）從RS、TA和CD中分離出HAH，通過(guò)HPLC對(duì)HAH濃縮物的化學(xué)表征顯示，它們包含半乳糖、阿拉伯糖、木糖和葡萄糖。RS、TA和CD衍生的HAH濃縮物的總酚含量分別為37.53、56.78和48.08 mg GAE/g。在益生元活性實(shí)驗(yàn)中，五種乳酸菌（LAB）分離株Q1B、Q2A、Q3B、G1C和G2B產(chǎn)生了不同的反應(yīng)，其中Q2A在RS-HAH中生長(zhǎng)最快，而Q3B在TA-HAH中生長(zhǎng)最慢。此外，表現(xiàn)出最高生長(zhǎng)性能的分離株Q2A、Q3B、G1C和G2B通過(guò)MALDI-TOF和16S rRNA測(cè)序被鑒定為短乳桿菌。所有測(cè)試的LAB分離株在粗制HAH制劑中表現(xiàn)出雙相生長(zhǎng)，以最大化利用碳源促進(jìn)其增殖。這表明所選的LAB分離株是半纖維素糖的有效降解者。這為將木質(zhì)纖維素生物質(zhì)轉(zhuǎn)化為益生元半纖維素自水解物鋪平了道路，并通過(guò)提高資源效率增強(qiáng)了環(huán)境可持續(xù)性。
Doi：10.1007/s11356-024-33611-4

| Genetic Diversity Analysis of Greater Yam (Dioscorea alata L.) Collections Using Tuber Morphology and Simple Sequence Repeats (SSR) Markers
研究單位：  菲律賓洛斯巴尼奧斯學(xué)院農(nóng)業(yè)和食品科學(xué)學(xué)院作物科學(xué)研究所
 
摘要：大薯是熱帶和亞熱帶地區(qū)重要的主食作物，具有重要的營(yíng)養(yǎng)和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。了解大薯種質(zhì)資源的遺傳多樣性對(duì)于育種計(jì)劃、保護(hù)工作和可持續(xù)利用至關(guān)重要。本研究旨在利用塊莖形態(tài)和簡(jiǎn)單序列重復(fù)（SSR）標(biāo)記評(píng)估大薯的遺傳多樣性。

研究利用54份來(lái)自菲律賓國(guó)家植物遺傳資源實(shí)驗(yàn)室、維薩亞斯州立大學(xué)和菲律賓洛斯巴諾斯大學(xué)作物科學(xué)研究所的148份大薯材料的多樣性進(jìn)行了評(píng)估。在54個(gè)SSR標(biāo)記中，有50個(gè)SSR標(biāo)記擴(kuò)增出多態(tài)性條帶，其多態(tài)性信息含量（PIC）值在0.65~0.89之間。隨后的聚類分析生成了9個(gè)不同的簇，Jaccard的距離指數(shù)為0.85，表明大薯樣本之間存在 85% 的差異。每個(gè)簇包含不同數(shù)量的樣本：簇 I 包含 3 個(gè)，簇 II 包含 24 個(gè)，簇 III 包含 15 個(gè)，簇 IV 包含 31 個(gè)，簇 V 包含 2 個(gè)，簇 VI 包含 4 個(gè)，簇 VII 包含 11 個(gè)，簇 VIII 包含 27 個(gè)，簇 IX 包含 31 個(gè)樣本。基于 5000 次重采樣的多尺度引導(dǎo)樹(shù)分析，在 95% 的置信水平下，簇 II、IV、VIII 和 IX 的近似無(wú)偏 (AU) p 值大于 0.95。因此，148 份大薯材料分子分析獲得的高差異率表明其具有較高的遺傳多樣性。PHL 33537、LA 068B、PHL 33550、PHL 31889、LA 110、LA147、TABACO 和 LA 597 這 8 份材料有望成為未來(lái)育種計(jì)劃的親本。此外，獲得的信息對(duì)于各種山藥改良計(jì)劃和遺傳資源保護(hù)措施至關(guān)重要。
Doi.org/10.62550/CE031023

Reference:
[1]  Alena Zolotarenko and Sergey Bruskin. IQGAP3 Is an Important Mediator of Skin Inflammatory Diseases. Int. J. Mol. Sci. 2024, 25(8), 4545; https://doi.org/10.3390/ijms25084545
[2] M. Zamorano-Cataldo a, I. Vega-Vásquez b, C. García-Navarrete b, J. Toledo b, D. Bustamante a, F. Ezquer c, F.A. Urra a d e, N. Farfán-Troncoso a, M. Herrera-Marschitz a, P. Morales a f. Mitochondrial dynamics and sex-specific responses in the developing rat hippocampus: Effect of perinatal asphyxia and mesenchymal stem cell Secretome treatment. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research, Volume 1871, Issue 8, December 2024, 119851; https://doi.org/10.1016/j.bbamcr.2024.119851
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[4] Mawish Mahroof, Rouf Ahmad Dar, Ruqeya Nazir, Md Niamat Ali, Bashir Ahmad Ganai. Valorization of rice straw and vascular aquatic weeds for sustainable prebiotic hemicellulosic autohydrolysate production: Extraction, characterization and fermentability. Environ Sci Pollut Res Int, 2024 May;31(24):35744-35759; https://doi.org/10.1007/s11356-024-33611-4.
[5] G. Koteswara Rao a, Chintan Kapadia b, N.B. Patel a, K.D. Desai a, P.N. Narasimha Murthy. Genetic diversity analysis of greater yam (Dioscorea alata L.) genotypes through RAPD and ISSR markers. Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, Volume 23, January 2020, 101495; https://doi.org/10.1016/j.bcab.2020.101495