Ion PGM™微生物測序解決方案

半導(dǎo)體測序
      Ion半導(dǎo)體測序讓測序既快速，又經(jīng)濟(jì)。如今，更多實(shí)驗(yàn)室采用強(qiáng)大的新一代測序技術(shù)——通量增加，準(zhǔn)確性提高，讀取更長——以便更快獲得微生物的答案。有了Ion Torrent™個(gè)人化操作基因組測序儀(PGM™)，您能夠從基因組定向區(qū)域(如多位點(diǎn)序列分型(MLST))的測序更快推進(jìn)到完整基因組的測序，而費(fèi)用僅為毛細(xì)管電泳測序的一小部分。有了全基因組鳥槍法測序(WGS)，您能夠捕獲整個(gè)基因組中的單堿基改變，而無需物種的參考序列信息。
 
成熟：在短短兩年的時(shí)間內(nèi)，科學(xué)家們已利用Ion PGM™測序儀發(fā)表了80多篇微生物學(xué)方面的同行評議文章。
簡約：經(jīng)濟(jì)的全基因組測序讓微生物學(xué)家能夠在使用單一技術(shù)時(shí)提高鑒別能力和準(zhǔn)確性。
快速：Ion PGM™測序儀比其他測序儀更快，只需4小時(shí)即可獲得長讀取(400個(gè)堿基)測序結(jié)果。

微生物測序單日流程       目前對于較長、準(zhǔn)確的讀取(reads)，采用400個(gè)堿基對的測序可在一天之內(nèi)完成由Ion PGM系統(tǒng)動(dòng)力操縱的de novo測序。
      簡化的樣品制備和應(yīng)用特異的數(shù)據(jù)分析方案進(jìn)一步簡化了微生物測序，使得微生物研究的各個(gè)領(lǐng)域都有重大突破。        三種測序芯片可供選擇，意味著您能夠根據(jù)特定應(yīng)用的需求來選擇測序通量，從而節(jié)省您的時(shí)間和經(jīng)費(fèi)。

微生物測序應(yīng)用
發(fā)現(xiàn) & 鑒定
      全基因組鳥槍法測序?yàn)槲⑸�物的發(fā)現(xiàn)與鑒定提供了重要的新機(jī)會(huì)。對于鑒定微生物基因組結(jié)構(gòu)的研究人員而言，完整基因組的de novo測序和組裝是至關(guān)重要的一步。Ion Torrent™半導(dǎo)體測序徹底改變了微生物研究中的de novo測序，它提供了一個(gè)簡單、低成本的系統(tǒng)，能在一天內(nèi)帶來準(zhǔn)確的結(jié)果。隨著在Ion PGM™系統(tǒng)上實(shí)現(xiàn)400 bp測序，測序組裝指標(biāo)將比以往任何時(shí)候都好，帶您走上全基因組測序的捷徑。
 
細(xì)菌分型
       快速準(zhǔn)確的分型對于監(jiān)測或鑒別細(xì)菌或病毒、闡釋細(xì)菌傳播鏈或了解特定人群的健康和疾病狀況均十分重要。Ion半導(dǎo)體測序匹配Ridom™ SeqSphere+™自動(dòng)化軟件能夠使任何微生物學(xué)家得以利用全基因組的方法來實(shí)現(xiàn)細(xì)菌分型。Ion PGM™系統(tǒng)能夠提供快速、低成本的完整基因組序列信息，而不是僅對幾個(gè)感興趣的區(qū)域進(jìn)行測序。通過采用成百上千個(gè)分型基因，可對個(gè)別菌株實(shí)現(xiàn)更高分辨率和更為準(zhǔn)確的分型。在一個(gè)工作日內(nèi)，即可對特定分離株進(jìn)行測序和鑒定，從而有望為疾病爆發(fā)的監(jiān)測提供實(shí)時(shí)結(jié)果。
 
病毒分型
      為了集中目標(biāo)完成進(jìn)化模式和病原體出現(xiàn)的預(yù)測，Ion PGM™系統(tǒng)匹配PathAmp™ FluA試劑以及Torrent Suite™軟件的病原體分析儀插件為甲型流感病毒完整基因組測序提供了最新型的工作流程。利用高度準(zhǔn)確的序列數(shù)據(jù)，研究人員能夠在一天之內(nèi)實(shí)現(xiàn)甲型流感病毒的分型，從而啟動(dòng)更為有效的流感監(jiān)測。這可使您得以精心優(yōu)選疫苗菌株，并改進(jìn)未來抗原特性的預(yù)測。
 
宏基因組學(xué)
       Ion半導(dǎo)體測序通過全基因組測序或?qū)��?xì)菌16S rRNA基因的定向測序(16S測序)來加速和簡化宏基因組研究。因無需在測序之前克隆樣品，避免了抽樣時(shí)的一個(gè)主要偏向。樣品在Ion PGM™系統(tǒng)上的直接測序可快速開展，有了更多擴(kuò)增子，可更好地區(qū)分不同生物體。與其他新一代測序儀不同，PGM™系統(tǒng)讓您輕松讀取低復(fù)雜度的序列。