自封式濾膜在環(huán)境DNA采樣中的應(yīng)用

      美國Smith公司自封式濾膜的應(yīng)用  

 

      在傳統(tǒng)的水環(huán)境DNA采樣過程中，研究人員主要依賴于現(xiàn)場的的水樣過濾及保存樣品的時(shí)效性，例如低溫保存、及時(shí)取出濾膜使用乙醇保存等等措施，以防止樣品在運(yùn)輸過程中的DNA降解。然而，任何以上繁多的濾膜轉(zhuǎn)移、保存步驟都會(huì)變相增加樣品污染的風(fēng)險(xiǎn)，從而影響DNA檢出率，且費(fèi)時(shí)費(fèi)力，往往在采樣點(diǎn)貨實(shí)驗(yàn)室浪費(fèi)大量寶貴的時(shí)間。

      自封式濾膜——Self-preserving filter pack是一種先進(jìn)的過濾套裝，是一款美國華盛頓大學(xué)研發(fā)的專用于背負(fù)式水體基因采樣器的專用耗材，由可生物降解的親水性材料組成，可以自動(dòng)干燥捕獲到的eDNA物質(zhì)，不用對濾膜進(jìn)行單獨(dú)轉(zhuǎn)移、冷藏及化學(xué)試劑添加。

       由華盛頓大學(xué)生物專家及Smtih-root公司研發(fā)人員撰寫的一篇發(fā)表在British Ecological Society刊物上的文章：《A self‐preserving, partially biodegradable eDNA filter》中描述：研究人員選取了野外池塘中的6個(gè)樣本進(jìn)行現(xiàn)場取樣，分別使用自封式濾膜及傳統(tǒng)過濾方法，將自封式濾膜進(jìn)行室溫保存，將傳統(tǒng)濾膜進(jìn)行乙醇低溫保存，結(jié)果表明使用自封式濾膜獲取到的DNA含量為傳統(tǒng)方式的2倍。(paired t test, p = 0.020).

自封式濾膜組成：
 

自封式濾膜的操作：

       自封式濾膜必須搭配背負(fù)式水體eDNA采樣器或便攜式eDNA采樣器使用，以下式相關(guān)設(shè)備指標(biāo)：

 
1、具備定量采樣功能
2、采樣器攜帶方式：手提式
3、濾膜材質(zhì)：高分子合成樹脂材料
4、具備自封技術(shù)：現(xiàn)場無需加注酒精等緩存液，樣品運(yùn)輸無需冷凍
5、保存時(shí)間：延緩DNA降解大于90個(gè)自然日
6、過濾套裝具備常溫運(yùn)輸能力
7、水泵：空氣泵
8、電壓：12V
9、野外電池壽命：8小時(shí)
10、容積：2L
11、抽濾管管徑：0.25英寸
12、濾膜：0.45μm,1.2μm，5μm   材質(zhì)：PES
13、抽濾速度：2L/min
14、采樣具備震動(dòng)回饋
15、采樣管長度：1米
16、電池類型：鉛酸電池