JVI:昆蟲(chóng)利用siRNA而非miRNA抵御病毒侵染
瀏覽次數(shù):2402 發(fā)布日期:2012-11-22
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棉鈴蟲(chóng)(Helicoverpa armigera),是夜蛾科昆蟲(chóng)的一種,寄主植物有20多科200余種,其中大部分為重要栽培作物,是棉花的主要害蟲(chóng)之一。棉鈴蟲(chóng)單核衣殼核多角體病毒(HaSNPV)是一種桿狀病毒,能專(zhuān)一性地感染棉鈴蟲(chóng),作為生物殺蟲(chóng)劑已得到廣泛應(yīng)用。
近日澳大利亞昆士蘭大學(xué)的研究人員對(duì)棉鈴蟲(chóng)免疫系統(tǒng)是如何應(yīng)答并抵御HaSNPV侵染的機(jī)制進(jìn)行研究,并將研究成果發(fā)表在Journal of Virology的10月刊上*。研究人員首先通過(guò)對(duì)感染HaSNPV的棉鈴蟲(chóng)進(jìn)行小RNA深度測(cè)序(LC Sciences,聯(lián)川生物美國(guó)母公司提供技術(shù)服務(wù)),發(fā)現(xiàn)大量small read(約20個(gè)核苷酸)可比對(duì)至HaSNPV基因組,并且這些Read比對(duì)到病毒基因組熱點(diǎn)區(qū)的特定開(kāi)放閱讀框(ORF)上,這些ORF大部分為結(jié)構(gòu)基因和輔助晚期基因。隨后,利用miRDeep在HaSNPV基因組上預(yù)測(cè)可做為pre-miRNA的潛在莖環(huán)結(jié)構(gòu)。通過(guò)分析小RNA序列與潛在莖環(huán)結(jié)構(gòu)的比對(duì)結(jié)果,Read count,負(fù)義鏈數(shù)量,雙鏈堿基配對(duì)數(shù)量以及其他參數(shù),研究人員判定所有預(yù)測(cè)的莖環(huán)結(jié)構(gòu)都不符合pre-miRNA的特征。在排除這些小RNA是miRNA的可能性后,這些小RNA被認(rèn)定是由Dicer-2,昆蟲(chóng)中參與RNAi應(yīng)答的主要酶,加工產(chǎn)生的病毒短干擾RNA(v-siRNA)。
上述研究表明,昆蟲(chóng)中RNAi途徑在抗RNA病毒應(yīng)答過(guò)程中發(fā)揮著主要作用。應(yīng)答過(guò)程為剪切雙鏈RNA基因組或復(fù)制過(guò)程中產(chǎn)生的中間體成為v-siRNA,然后通過(guò)降解病毒轉(zhuǎn)錄本以達(dá)到抵御病毒侵染的目的。
*:Jayachandran B, Hussain M, Asgari S. (2012) RNA interference as a cellular defense mechanism against the DNA virus, baculovirus. J Virol [Epub ahead of print].
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