大量的證據(jù)表明,microRNAs(miRNAs)豐富地存在于肝臟中,并對(duì)肝臟的發(fā)育,再生及疾病的發(fā)生發(fā)揮著重要作用。為了更好地促進(jìn)肝臟疾病與海洋生物的研究,近日,浙江理工大學(xué)的呂正兵教授,領(lǐng)銜其團(tuán)隊(duì),對(duì)條紋斑竹鯊肝臟的miRNA進(jìn)行了深入研究,研究成果發(fā)表在7月刊的BioMed Research International上。
雖然條紋斑竹鯊的基因組測(cè)序尚未完成,但最近提出的葉吻銀鮫(callorhinchus milii)基因組是一個(gè)軟骨魚類基因組理想模型。因此,研究人員使用葉吻銀鮫基因組預(yù)測(cè)pre-miRNA的發(fā)夾結(jié)構(gòu)。通過小RNA測(cè)序,共有91個(gè)已知的miRNA和166個(gè)假定候選的miRNAs首次在條紋斑竹鯊中得到鑒定(小RNA測(cè)序服務(wù)由聯(lián)川生物完成)。通過目標(biāo)預(yù)測(cè)和GO分析, 在91個(gè)已知的miRNA中,篩選出46個(gè)miRNAs,特別是細(xì)胞增殖和生長(zhǎng)相關(guān)的miRNAs。
研究人員進(jìn)一步通過RT-PCR分析條紋斑竹鯊的miRNAs簇以及miRNAs的表達(dá)。在正常和再生肝組織中篩選出差異表達(dá)的基因,通過鑒定得到十個(gè)序列。
本研究是關(guān)于軟骨魚miRNA的首次全面報(bào)道, 為條紋斑竹鯊現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫添加了大量新的miRNA序列信息,并為進(jìn)一步研究miRNAs在條紋斑竹鯊肝臟發(fā)育中的功能奠定了基礎(chǔ)。不僅為魚類也為其它物種的肝臟miRNA研究做出了貢獻(xiàn)。
*Conger Lu, et al. (2013) Study of MicroRNAs Related to the Liver Regeneration of the Whitespotted Bamboo Shark, Chiloscyllium plagiosum. BioMed Research International . [article]