illumina測(cè)序新品NextSeq1000與NextSeq2000性能的預(yù)測(cè)

大家好，正床上躺著看《慶余年》的我收到了宇哥發(fā)來(lái)的微信，才想起來(lái)今天竟到了illumina新品發(fā)布會(huì)的日子，看著手機(jī)上的產(chǎn)品宣傳圖片我不由的想起來(lái)家里的加濕器，還是自帶小夜燈和觸控屏幕的空氣加濕器（只不過(guò)這加濕器有點(diǎn)貴啊，21萬(wàn)美刀^起）。
 

圖片來(lái)源于illumina中國(guó)官網(wǎng)

接下來(lái)我們來(lái)簡(jiǎn)單介紹一下illumina的新產(chǎn)品—NextSeq1000與NextSeq2000，我粗略的看了下illumina官網(wǎng)上新產(chǎn)品的宣傳彩頁(yè)，頓感些許失落，但是誰(shuí)知后面會(huì)不會(huì)也難逃“真香”定律呢？

前幾天我寫(xiě)了一篇《2020 illumina新品發(fā)布預(yù)測(cè)》的文章，帶著“必然蒙對(duì)”的傲嬌對(duì)號(hào)入座的瞄了一下我當(dāng)時(shí)的預(yù)測(cè)，嗯！就是這個(gè)。

在我當(dāng)時(shí)的新品預(yù)測(cè)中，其中一個(gè)預(yù)測(cè)是illumina可能會(huì)發(fā)布一款介于NextSeq系列和Novaseq6000之間的機(jī)型，以補(bǔ)充兩機(jī)型之間的“產(chǎn)品斷崖”，該機(jī)器的數(shù)據(jù)產(chǎn)量可以相當(dāng)于Novaseq的SP芯片（800M Reads，PE150，240Gb/Flowcell），而測(cè)序試劑的價(jià)格將介于NextSeq High-Output芯片（$40/Gb）和Novaseq SP芯片($18/Gb)之間。我當(dāng)時(shí)預(yù)測(cè)的這款機(jī)器的主要目標(biāo)客戶群體是以北美地區(qū)的Hiseq系列或者Nextseq系列使用者為主，之所以如此判斷，原因有二：

第一,是我預(yù)測(cè)illumina2019年在中國(guó)市場(chǎng)幾乎是零增長(zhǎng)，業(yè)績(jī)將基本與2018年持平（2018年illumina大中華區(qū)營(yíng)收為3.65億美金，占總營(yíng)收的11%），造成這份態(tài)勢(shì)，華大智造MGISEQ-2000測(cè)序系統(tǒng)優(yōu)秀的市場(chǎng)表現(xiàn)“功不可沒(méi)”，如果illumina發(fā)布介于NextSeq和Novaseq之間的機(jī)型，那么該機(jī)器的主要性能參數(shù)將與華大智造的MGISEQ-2000接近，所以我不認(rèn)為illumina推出這類(lèi)機(jī)型會(huì)對(duì)中國(guó)市場(chǎng)的客戶有太大的吸引力，自然中國(guó)市場(chǎng)（甚至是亞太市場(chǎng)）也不會(huì)是其主要目標(biāo)客戶群體（起碼短時(shí)間內(nèi)不是） 

第二，北美才是illumina的大本營(yíng)（第一大市場(chǎng)，2018年illumina美國(guó)市場(chǎng)營(yíng)收為17.73億美元，占總營(yíng)收的53%），所以這次韭菜還是要回家割，業(yè)績(jī)?cè)鲩L(zhǎng)的壓力還是要靠家里人來(lái)一起“扛”的。北美地區(qū)還有大量的Hiseq2500和Hiseq4000等老舊機(jī)型在服役，這些機(jī)型開(kāi)機(jī)成本較高、運(yùn)行速度較慢、通量較大，而Nextseq系列的單位數(shù)據(jù)成本又太高、數(shù)據(jù)產(chǎn)量上也無(wú)法滿足后續(xù)單細(xì)胞測(cè)序、基于液體活檢的Pan-Cancer等應(yīng)用的檢測(cè)需求，所以一款“中間機(jī)型”的需求應(yīng)運(yùn)而生。但這讓我想到了美國(guó)的智能手機(jī)市場(chǎng)，用戶的選擇真是少到可憐啊，不是蘋(píng)果就是三星，最多加個(gè)LG，哪有我們幸福... ...另外美國(guó)這么多CLIA實(shí)驗(yàn)室，這RUO版本的機(jī)型也是可以拿過(guò)來(lái)直接用的。

另外，剛看到Genomeweb的推文，Roche與illumina將基于NextSeq550Dx測(cè)序平臺(tái)合作開(kāi)發(fā)體外診斷試劑盒，而且illumina宣布即將推出NovaseqDx，所以如我預(yù)測(cè)，NovaseqDx即將來(lái)臨，后續(xù)將聯(lián)合DRAGEN Bio-IT在Pan-Cancer（ctDNA）、cWES和cWGS應(yīng)用中擔(dān)當(dāng)重任。

好的，上面啰嗦這么多，總結(jié)成一句就是想說(shuō)明咱這預(yù)測(cè)不是胡扯，那么接下來(lái)咱們簡(jiǎn)單看一下本次發(fā)布的新品具體的參數(shù)。

首先我們來(lái)看一下尺寸大小

NextSeq550的長(zhǎng)寬高為 63.5cm×53.3cm×58.4cm，毛重為151.5kg。

Nextseq2000的長(zhǎng)寬高為65cm×60cm×60cm，重量為141kg。

從體型上來(lái)看，這個(gè)小夜燈加濕器與Nextseq550是基本一樣的。

接下來(lái)我們?cè)賮?lái)看一下四款儀器的性能參數(shù)對(duì)比表

 最后我們還說(shuō)一下NextSeq1000/2000有哪些創(chuàng)新的地方？

 但因?yàn)槟壳爱a(chǎn)品細(xì)節(jié)公開(kāi)的還是太少（宣傳75項(xiàng)創(chuàng)新�。�，并且下面的內(nèi)容，宣傳彩頁(yè)上都是現(xiàn)成的，所以我還是長(zhǎng)話短說(shuō)為大家做簡(jiǎn)單歸納：

第一，NextSeq1000/2000測(cè)序系統(tǒng)直接搭載了DRAGEN Bio-IT FPGA Secondary analysis，簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)就是分析加速系統(tǒng)�？梢杂脕�(lái)大大加快變異檢測(cè)的分析速度。

第二，簡(jiǎn)化的上機(jī)操作流程，將廢液桶和測(cè)序試劑卡槽集成在一起，待loading的文庫(kù)也加入試劑卡槽，測(cè)序芯片插入試劑卡槽，再將測(cè)序試劑盒插入測(cè)序儀，搞定！

第三，可以在云端對(duì)本次測(cè)序的運(yùn)行模式進(jìn)行設(shè)定（例如讀長(zhǎng)、Barcode等測(cè)序參數(shù)）。
 

這樣看下來(lái)這機(jī)器有點(diǎn)AIOT的意思啦，好了，今天就到這里，后續(xù)獲得更多新品細(xì)節(jié)后再與大家交流學(xué)習(xí)。

掃一掃關(guān)注微信公眾號(hào)
基因Share