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如何在PCR檢測過程中降低檢測結果假陰性概率

瀏覽次數:2516 發(fā)布日期:2020-5-5  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
  1. 什么是PCR技術?
PCR技術又稱為聚合酶鏈式反應。是一種用于放大擴增特定的DNA片段的分子生物學技術,它可看作是生物體外的特殊DNA復制,PCR的最大特點是能將微量的DNA大幅增加。
在新冠病毒檢測中,核酸檢測被定義為臨床診斷的金標準,RT-PCR技術被反復提到,它是一種將RNA反轉錄與PCR相結合的技術。首先在反轉錄酶的作用下,將提取到的RNA合成cDNA,再以cDNA為模板,在DNA聚合酶作用下不斷擴增(變性-退火-延伸多個循環(huán))合成目的片段并進行分析。
 
  1. PCR用水
PCR技術目前多搭配試劑盒使用,也有用戶自行制備反應體系,無論哪個過程都需要使用水。無論是近年來季節(jié)性爆發(fā)的甲流乙流,還是目前全球都在經歷的新冠病毒,在檢測過程中都涉及一個痛點,那就是如何盡可能提高核酸檢測的準確性,減少假陰性結果出現的可能性。
我們首先分析一下假陰性結果出現的可能性,以新冠病毒核酸檢測為例,假陰性的主要原因有:
  • 病人病程:不同病程,患者體內病毒載量不同
  • 采樣部位:咽拭子,鼻咽拭子,痰液,肺泡灌洗液等不同采樣部位病毒載量均不同
  • 采樣準確性:拭子質量,工作人員操作等
  • 試劑盒的質量:引物設計以及水質控制
為了順利將提取到的RNA反轉錄并實現DNA的成功擴增,必須抑制核糖核酸酶(RNases)的降解作用,如果試劑盒用水內含RNases,將極有可能導致假陰性結果的出現。
 
  1. 去除RNases的主要方法
  • 高壓滅菌:即便是在180℃下高壓滅菌4h之后,RNases仍保持某些活性,且某些特定細菌失活會釋放更多的RNases
  • DEPC法(二乙基焦碳酸酯處理法):利用二乙基焦碳酸酯(DEPC)處理方法使化學酶失活是用來抑制水溶液中RNases活性的常見方法。然而,二乙基焦碳酸酯是一種可疑致癌物,處理須小心;同時該方法雖然能夠使酶永久失活,卻無法將其從水中去除,同時清除多余的DEPC過程中,會產生乙醇,二氧化碳等其他污染物。
  • 超濾法:超濾是一種真正能夠從水溶液中清除RNases的方法。默克Milli-Q選用內置在丙烯腈丁苯橡膠(ABS)外殼中的聚砜超過濾膜作為超濾柱的主要成分,在一定水流速一定濃度范圍內,超濾具有充分的截留作用。超濾處理可有效取代DEPC處理方法生產無RNase水。
 
 
  1. Milli-Q生產無RNases水解決方案:
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來源:默克生命科學
聯(lián)系電話:400-900-3055轉8
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