宏基因組測(cè)序是對(duì)環(huán)境樣品中的微生物群落的基因組進(jìn)行高通量測(cè)序,主要研究微生物種群結(jié)構(gòu)、基因功能活性、微生物之間的相互協(xié)作關(guān)系以及微生物與環(huán)境之間的關(guān)系。
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宏基因組研究策略的出現(xiàn),使得我們無(wú)需分離培養(yǎng)單個(gè)微生物,利用高通量測(cè)序技術(shù)即可對(duì)來(lái)自特定環(huán)境或人體部位的微生物群落展開(kāi)全局研究。16S rDNA因其序列在物種間的高度多樣性,成為細(xì)菌分類學(xué)研究的“分子鐘”,其序列包含可變區(qū)和保守區(qū),可變區(qū)因細(xì)菌而異,且變異程度與細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育密切相關(guān)。16S rDNA測(cè)序是通過(guò)提取微生物菌群的DNA,選擇可變區(qū)的特定區(qū)段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,再結(jié)合高通量測(cè)序分析,幫助研究人員大規(guī)模鑒定細(xì)菌群落組成,表達(dá)豐度,以及開(kāi)展系統(tǒng)進(jìn)化分析,促進(jìn)了我們對(duì)微生物群落與環(huán)境互作,以及與人類互作的理解。
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