NextGenPCR系統(tǒng)在猴痘最高警戒級別篩查與預(yù)防的應(yīng)用

MPOX（又名。猴痘（MPXV）是一種由猴痘病毒引起的傳染病。它會導(dǎo)致疼痛的皮疹、淋巴結(jié)腫大和發(fā)燒。大多數(shù)人完全康復(fù)，但有些人會病得很重。任何人都可能患上猴痘。目前，世界多個地區(qū)發(fā)生了多國猴痘疫情。猴痘病毒感染的確認基于核酸擴增檢測 （NAAT），使用實時或常規(guī)聚合酶鏈反應(yīng) （PCR） 檢測病毒 DNA 的獨特序列。PCR可以單獨使用，也可以與測序結(jié)合使用。

猴痘病毒變異株監(jiān)測，使用NextGenPCR®文庫制備進行納米孔測序

測序可以跟蹤病毒的傳播以及可能使病毒更具傳染性或危險的任何突變。NextGenPCR測序試劑盒與NextGenPCR設(shè)備相結(jié)合，可提供超快的納米孔測序。該試劑盒還可以與其他PCR設(shè)備配合使用。NextGenPCR設(shè)備已被證明具有超快且非常精確的特點，可為納米孔測序產(chǎn)生最終質(zhì)量的擴增子。

對人畜共患猴痘病毒（MPXV）感染進行快速基因組監(jiān)測可以為了解病毒的地理/人口傳播提供有價值的見解，并指導(dǎo)公共衛(wèi)生干預(yù)措施。在當(dāng)前的MPXV測序方法中，從樣品中分離的核苷酸直接在納米孔測序儀上進行測序。現(xiàn)有方法效率低下，因為它的基因組覆蓋率低，目標(biāo)片段的測序深度低，而且由于樣本無法進行多路復(fù)用，因此成本高昂。為了幫助實驗室進行MPXV基因監(jiān)測工作，Molecular Biology Systems開發(fā)了一種超快文庫制備方案，用于分析樣本中的MPXV基因組。190kb MPXV 基因組的擴增是通過使用基于 PCR 的 2.5kb 片段（總共 88 個擴增子）的擴增子來實現(xiàn)的。使用NextGenPCR®超快PCR化學(xué)試劑，可在42分鐘內(nèi)完成方案的完整PCR循環(huán)程序。

該實驗設(shè)置是一種使用NextGenPCR和Oxford Nanopore技術(shù)的組合對猴痘病毒全基因組進行測序的方法。該實驗旨在提供猴痘病毒的快速基因組監(jiān)測，這有助于指導(dǎo)公共衛(wèi)生干預(yù)措施。這實驗設(shè)置與現(xiàn)有方法相比具有幾個優(yōu)勢，例如更快的實驗流程時間、更高的靈敏度和更低的成本。該方案還成功應(yīng)用于對荷蘭和美國患者的猴痘病毒基因組進行測序。

愛爾蘭都柏林國家病毒參考實驗室的高級臨床科學(xué)家邁克爾·卡爾（Michael Carr）教授進行了一項全國性研究，以闡明猴痘病毒（MPXV）在愛爾蘭的進入和傳播。他使用的方案利用定制設(shè)計的 NextGenPCR® MPXV 引物池（貨號 #50025）進行 PCR 平鋪，使用戶能夠擴增完整的 190 kb MPXV 基因組，然后可以進行完整測序。使用下一代測序分析所得擴增子，以準確確定目前在愛爾蘭傳播的 MPXV 菌株。有了這些數(shù)據(jù)，卡爾實驗室能夠為愛爾蘭的決策者提供關(guān)鍵信息，以預(yù)防未來可能爆發(fā)的猴痘疫情。

閱讀更多關(guān)于他的研究 Multiple Introductions of Mpox virus to Ireland during the 2022 International Outbreak 并參考 NextGenPCR® 產(chǎn)品頁面 了解更多信息。

荷蘭MBS公司NextGenPCR系統(tǒng)，使用超快速NextGenPCR熱循環(huán)技術(shù)為Oxford Nanopore測序平臺提供多種基于PCR的文庫制備解決方案。結(jié)合NextGenPCR文庫準備工作流程，可將實驗室的通量提高至400%。

使用NextGenPCR技術(shù)進行文庫制備的好處：

• 當(dāng)時間緊迫時，可更快獲得測序結(jié)果。

• 適用于多重擴增子文庫制備。

• 每天最多增加400%的數(shù)據(jù)量。

• 短基因組模板和長基因組模板的穩(wěn)健和高精度PCR。

• 直接PCR，無需核酸提取。

   

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