國際知名生物芯片技術(shù)公司及其研發(fā)重點

生物芯片技術(shù)系列——國際知名生物芯片技術(shù)公司及其研發(fā)重點

現(xiàn)在全世界已有幾十家公司專門從事芯片的研究和開發(fā)工作，而且已有較為成型的產(chǎn)品和設(shè)備問世。

其中，基因芯片的商業(yè)化開發(fā)相對成熟，美國的Affymetrix公司是世界上最有影響的基因芯片開發(fā)制造商。目前Affymetrix公司已開發(fā)全套的生物芯片技術(shù)相關(guān)產(chǎn)品，包括* 研究應(yīng)用系列芯片及相關(guān)試劑和試劑盒、工具數(shù)據(jù)庫及芯片分析軟件工具、芯片制備系列平臺儀器及其零配件、掃描檢測儀器、雜交反應(yīng)設(shè)備、生物芯片相關(guān)技術(shù)手冊及指南等。Affymetrix公司是目前全球基因芯片行業(yè)的領(lǐng)頭羊，以其專利的寡聚核苷酸原位光刻合成技術(shù)，年產(chǎn)各類寡聚核苷酸基因芯片達(dá)到幾十萬張，占據(jù)了表達(dá)譜基因芯片科研市場的一半以上，經(jīng)過了將近十年的研究開發(fā)，已在國際上贏得了很高的盛譽，同時成為為數(shù)極少的已盈利的生物芯片公司。Affymetrix公司的基因芯片為寡核苷酸芯片（Oligo芯片），這類芯片具有極高的特異性和靈敏度，重復(fù)性好，假陽性率非常低，是目前世界上最先進(jìn)的基因芯片。此外，BioRobotics公司、Cartesian Technologies公司、 TeleChem International Inc、Standford大學(xué)專長于芯片制備方法和制備系統(tǒng)的研發(fā)，主要從事點樣制作系統(tǒng)的研究開發(fā)；例如GSI Lumonics公司、ScanArray System是權(quán)威的掃描儀專業(yè)供應(yīng)商；美國加州的Hyseq公司擁有最快的基因分析器；帕洛阿爾托的Syntenl公司生產(chǎn)的芯片衡量細(xì)胞中基因的活動有效，正利用基因芯片研究前列腺癌等疾病；Incyte制藥公司與Affymetrix公司：合作生產(chǎn)針對各種疾病的基因分析芯片供藥品研究使用。除了專業(yè)的生物芯片公司外，IT領(lǐng)域的傳統(tǒng)公司近年來也開始涉足生物芯片的開發(fā)生產(chǎn)，如Motorola、HP、IBM、Hitachi等公司。

而蛋白質(zhì)芯片由于在基礎(chǔ)研究和技術(shù)實現(xiàn)方面尚有諸多難題，因此其商業(yè)化步子還很小，據(jù)稱美國加州Ciphergen生物系統(tǒng)公司已有產(chǎn)品投放市場，而英國的Cambridge Antibody Technology 也在利用蛋白質(zhì)芯片從事研究、診斷和藥物發(fā)現(xiàn)工作。

目前知名的十家從事生物芯片研發(fā)的公司的技術(shù)情況簡要分析如下：

表 世界十大基因芯片研制單位技術(shù)情況一覽
公司 陣列方法 雜交方式 檢測 應(yīng)用領(lǐng)域
Affymetrix（美國）
20-25mer探針光引導(dǎo)合成在1.25/5.25cm2的硅片 10000-260000個 Oligo探針與30-40個標(biāo)記樣品cDNA/asRNA片斷 熒光 表達(dá)譜檢測多態(tài)性分析診斷
Brax（英國） Oligo合成后結(jié)合于芯片上 通用芯片上100個探針與標(biāo)記核酸 質(zhì)譜 診斷、表達(dá)譜檢測及新基因鑒定
Hyseq（美國） 500-2000ntDNA樣品印刷于0.6cm2/18cm2的膜 預(yù)組裝的5mer-Oligo打印于1.15的玻璃片 64/55000個樣品cDNA點與8000/300個7mer探針
通用1024個Oligo點探測10kbcDNA樣品，加標(biāo)記的5mer探針和連接酶 同位素 診斷、表達(dá)譜檢測、多態(tài)性分析、新基因鑒定及大規(guī)模測序
Incyte Pharmaceticals （美國）
壓電打印PCR產(chǎn)物或芯片上合成Oligos 1000最終可達(dá)10000個Oligo/PCR片斷與標(biāo)記RNA 熒光/同位素 表達(dá)檢譜測多態(tài)性分析診斷
Incyte Pharmaceticals （美國）
壓電打印PCR產(chǎn)物或芯片上合成Oligos 1000最終可達(dá)10000個Oligo/PCR片斷與標(biāo)記RNA 熒光/同位素 表達(dá)檢譜測多態(tài)性分析診斷
Molecular dynamics（美國）
500-5000nt的cDNA用筆打印于10 cm2玻璃片 10000個cDNA點與200-400nt標(biāo)記cDNA 熒光 新基因鑒定 表達(dá)譜檢測
Nanogen （美國）
預(yù)組裝的20mer的探針俘獲于電活化芯片位點 25/64/100/400/最終10000個Oligo點與200-400nt標(biāo)記cDNA 熒光 診斷及短的重復(fù)序列鑒定
Protogene Lab （美國）
通過打印于表面張力陣列將40-50mer Oligo合成于9 cm2玻璃片 8000個Oligo點與200-400nt標(biāo)記核酸樣品 熒光 表達(dá)譜檢測 多態(tài)性分析
Sequenom (德國，美國)
20-25mer探針合成后打印成陣列 250點，激光解吸-質(zhì)譜分析 質(zhì)譜 新基因鑒定
診斷及作圖
Synteni （美國）
500-5000nt cDNA用滴頭打印于4 cm2的玻璃片 10000個cDNA點與200標(biāo)記cDNA 熒光 新基因鑒定 表達(dá)譜檢測
德國癌癥研究所（德國） 約1000個PNA合成于8×10 cm2的芯片 熒光/質(zhì)譜 表達(dá)譜檢測及診斷

現(xiàn)在全世界已有幾十家公司專門從事芯片的研究和開發(fā)工作，而且已有較為成型的產(chǎn)品和設(shè)備問世。對國際上知名的43家生物芯片公司的主要從業(yè)領(lǐng)域進(jìn)行了統(tǒng)計（注：有的公司經(jīng)營多種業(yè)務(wù)），發(fā)現(xiàn)從事分析軟件的實際與開發(fā)的公司是數(shù)量最多的，其次是掃描儀的生產(chǎn)與制造，兩者的總和占生物芯片總業(yè)務(wù)的占30.5%�？梢�，目前國際上生物芯片開發(fā)的熱點是數(shù)據(jù)/信號的檢測獲得與分析。

表 世界知名生物芯片公司及研制單位的技術(shù)專長等情況一覽
從業(yè)領(lǐng)域 公司數(shù)量
分析軟件29
掃描儀17
點樣機(jī)14
表達(dá)陣列14
雜交溶液14
芯片制作12
接觸點樣12
樣品處理設(shè)備及試劑11
基因表達(dá)分析11
客戶定制芯片11
標(biāo)記探針或其他10
完整的雜交系統(tǒng)9
獨立的雜交系統(tǒng)9
突變檢測7
基因型分析6
cDNA庫5非接觸點樣4
DNA測序2

資料來源：上�？萍记閳笱芯克�分析整理