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生物研發(fā)服務(wù)

簡化基因組測序

原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估，標記位點分析，應(yīng)用分析，根據(jù)客戶需求進行個性化分析

服務(wù)類別：	測序/合成	總訪問：	1311
最后更新：	2013-9-3	半年訪問：	6
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服務(wù)商：上海派森諾生物科技有限公司

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服務(wù)介紹
公司簡介

簡化基因組測序

簡介：簡化基因組測序（Reduced-Representation Genome Sequencing, RRGS）顧名思義是對部分基因組進行序列測定。它是指利用RAD-seq和生物信息學(xué)方法，設(shè)計標記開發(fā)方案，富集特異性長度片段，應(yīng)用高通量測序技術(shù)獲得海量標簽序列來代表目標物種全基因組信息的測序方法。

一、技術(shù)路線

推薦平臺：Illumina HiSeq 2000

二、信息分析

1）未知參考基因組的信息分析流程

1.原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估

2.標記位點分析：

標記位點鑒定

SNPs位點鑒定

3.應(yīng)用分析：

SNP單體型圖譜分析

全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）

連鎖分析和QTL定位

種群進化分析

4.根據(jù)客戶需求進行個性化分析

2）已知參考基因組的信息分析流程

1.原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估

2.標記位點分析：

標記位點在基因組上定位

標記位點鑒定

SNPs位點鑒定

3.應(yīng)用分析：

SNP單體型圖譜分析

全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）

連鎖分析和QTL定位

種群進化分析

4.根據(jù)客戶需求進行個性化分析

三、送樣要求

1、動物組織樣品：要求新鮮動物組織，避免脂肪組織，每個樣品重量＞10 g。

2、血液樣品：每份新鮮血液樣本的體積＞5 mL。

3、植物樣品：要求新鮮較嫩的葉片組織，每個樣品重量＞10 g，干冰或者液氮保存寄送。

4、 DNA樣品：請?zhí)峁舛龋?00 ng/μl，總量＞20 μg的DNA，OD 260/280介于1.8~2.0之間，并確保DNA無降解。

5、樣品保存期間切忌反復(fù)凍融。

6、送樣管務(wù)必標清樣品編號，管口使用Parafilm 膜密封。

上海派森諾生物科技有限公司（以下簡稱“派森諾生物”）成立于2011年4月，公司總部位于上海市徐匯區(qū)，是在已有DNA一代測序合成平臺基礎(chǔ)上，以上海交通大學(xué)等海內(nèi)外高等學(xué)校和科研院所的專家教授團隊為技術(shù)依托，吸納了多名基因組學(xué)和生物信息學(xué)高級專業(yè)技術(shù)人員加盟組成的高科技生物技術(shù)公司。

公司之所以取名派森諾生物（Personalbio）是這樣考慮的：首先，人類基因組計劃實施和完成，全面開啟了生命科學(xué)新紀元，其正帶動著生物科學(xué)研究和應(yīng)用進入個性化時代；其次，測序技術(shù)的飛速發(fā)展，以測序中心獨攬?zhí)煜碌木置嬉矊⒈灰詫嶒炇覟閱挝粋€性化形式所打破和取代。另外，由于生物種類和客戶需求目標的多樣性，要求有針對性、個性化的專業(yè)服務(wù)。

派森諾生物緊緊跟蹤全球測序技術(shù)發(fā)展步伐，2011年率先引進了亞太區(qū)第一臺羅氏升級版測序平臺（Roche 454 FLX+ system）和中國第一臺Illumina新一代個人化測序平臺（Illumina MiSeq^TM），目前擁有Illumina HiSeq^TM2000、Illumina MiSeq^TM和Roche 454 FLX+三大高通量測序平臺，確保了對不同類型、不同物種的測序需要。

派森諾生物擁有一支實力雄厚的序列測定和信息分析團隊，在為合作伙伴提供標準化信息分析服務(wù)的基礎(chǔ)上，將根據(jù)客戶需要提供個性化的數(shù)據(jù)分析與培訓(xùn)。派森諾生物承諾，將為廣大合作伙伴提供三大免費服務(wù)：免費設(shè)計科學(xué)合理的實驗方案、免費提供常規(guī)生物信息分析和免費修改潤色英文文稿。

派森諾生物始終以“解析序列，詮釋生命”作為企業(yè)理念，秉承“立足客戶需要，滿足個性需求”的服務(wù)宗旨，專業(yè)提供動植物基因組測序、微生物基因組測序、宏基因組測序、RNA測序、簡化基因組及外顯子捕獲等技術(shù)服務(wù)。

目前公司合作伙伴遍布全國，包括中國科學(xué)院、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院、上海交通大學(xué)、華東理工大學(xué)、內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)、南京大學(xué)、瑞金醫(yī)院、新華醫(yī)院、國家海洋局第一海洋研究所、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)、溫州醫(yī)學(xué)院、上海海洋大學(xué)、山東農(nóng)業(yè)大學(xué)、重慶市畜牧科學(xué)院、揚州大學(xué)等，已經(jīng)完成和正在進行多項國家和省市重大或重點科研項目，受到合作伙伴的認同和好評。

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