擴增子測序

原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估，序列比對與分析，根據(jù)客戶需求進行個性化分析

服務(wù)類別：	測序/合成	總訪問：	2730
最后更新：	2013-9-3	半年訪問：	2
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服務(wù)商：上海派森諾生物科技有限公司

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服務(wù)介紹
公司簡介

簡介：擴增子測序是對特定長度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進行測序，分析序列中的變異。擴增子測序能夠根據(jù)不同需求，對目標(biāo)區(qū)域進行高覆蓋度的測序，還可以檢測到低頻突變。

二、信息分析

1. 原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估

2. 序列比對與分析

與參考序列比對

SNPs和InDel的檢測

3.根據(jù)客戶需求進行個性化分析

三、送樣要求

1. 樣品純度要求： OD值應(yīng)在1.8至2.0之間；電泳檢測無明顯非特異性雜帶，PCR產(chǎn)物條帶清晰、完整，混合PCR產(chǎn)物之間的長度差別不多于100bp。

2. 樣品濃度：純化后PCR產(chǎn)物濃度不低于10ng/ul。

3. 樣品總量：樣品總量不低于500ng。

4. 送樣管務(wù)必標(biāo)清樣品編號，管口使用Parafilm膜密封。仔細(xì)填寫DNA樣品信息表，提供DNA樣品具體濃度、體積、制備時間、溶劑名稱及物種來源。同時附上QC數(shù)據(jù)，包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測數(shù)據(jù)。如需進行多次樣品制備，需要提供多次樣品制備所需樣品。

5. 寄送樣品需要保持低溫環(huán)境，最好的方法是凍干郵寄，其次是溶于TE，當(dāng)然也可以溶于雙蒸水。

四、派森諾優(yōu)勢

派森諾生物擁有多個高端測序平臺，其中Illumina Miseq平臺讀長長，速度快，靈活性強，尤其適合于擴增子測序，可以保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性以及變異位點的發(fā)現(xiàn)。

上海派森諾生物科技有限公司（以下簡稱“派森諾生物”）成立于2011年4月，公司總部位于上海市徐匯區(qū)，是在已有DNA一代測序合成平臺基礎(chǔ)上，以上海交通大學(xué)等海內(nèi)外高等學(xué)校和科研院所的專家教授團隊為技術(shù)依托，吸納了多名基因組學(xué)和生物信息學(xué)高級專業(yè)技術(shù)人員加盟組成的高科技生物技術(shù)公司。

公司之所以取名派森諾生物（Personalbio）是這樣考慮的：首先，人類基因組計劃實施和完成，全面開啟了生命科學(xué)新紀(jì)元，其正帶動著生物科學(xué)研究和應(yīng)用進入個性化時代；其次，測序技術(shù)的飛速發(fā)展，以測序中心獨攬?zhí)煜碌木置嬉矊⒈灰詫嶒炇覟閱挝粋€性化形式所打破和取代。另外，由于生物種類和客戶需求目標(biāo)的多樣性，要求有針對性、個性化的專業(yè)服務(wù)。

派森諾生物緊緊跟蹤全球測序技術(shù)發(fā)展步伐，2011年率先引進了亞太區(qū)第一臺羅氏升級版測序平臺（Roche 454 FLX+ system）和中國第一臺Illumina新一代個人化測序平臺（Illumina MiSeq^TM），目前擁有Illumina HiSeq^TM2000、Illumina MiSeq^TM和Roche 454 FLX+三大高通量測序平臺，確保了對不同類型、不同物種的測序需要。

派森諾生物擁有一支實力雄厚的序列測定和信息分析團隊，在為合作伙伴提供標(biāo)準(zhǔn)化信息分析服務(wù)的基礎(chǔ)上，將根據(jù)客戶需要提供個性化的數(shù)據(jù)分析與培訓(xùn)。派森諾生物承諾，將為廣大合作伙伴提供三大免費服務(wù)：免費設(shè)計科學(xué)合理的實驗方案、免費提供常規(guī)生物信息分析和免費修改潤色英文文稿。

派森諾生物始終以“解析序列，詮釋生命”作為企業(yè)理念，秉承“立足客戶需要，滿足個性需求”的服務(wù)宗旨，專業(yè)提供動植物基因組測序、微生物基因組測序、宏基因組測序、RNA測序、簡化基因組及外顯子捕獲等技術(shù)服務(wù)。

目前公司合作伙伴遍布全國，包括中國科學(xué)院、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院、上海交通大學(xué)、華東理工大學(xué)、內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)、南京大學(xué)、瑞金醫(yī)院、新華醫(yī)院、國家海洋局第一海洋研究所、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)、溫州醫(yī)學(xué)院、上海海洋大學(xué)、山東農(nóng)業(yè)大學(xué)、重慶市畜牧科學(xué)院、揚州大學(xué)等，已經(jīng)完成和正在進行多項國家和省市重大或重點科研項目，受到合作伙伴的認(rèn)同和好評。

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