RNA-Seq

技術(shù)優(yōu)勢

數(shù)字化信號：測序直接獲得序列，無背景噪音，無交叉雜交；可鑒別序列間單個堿基的差異；

高通量：一次測序得到千萬條以上的序列；

檢測閾值寬：跨越6個數(shù)量級的寬檢測閾值，從幾個到數(shù)十萬個拷貝精確計數(shù)；

良好的重復(fù)性：深度測序保證了抽樣隨機(jī)性，重復(fù)性非常好，無需重復(fù)實驗；

高靈活性 ：依據(jù)客戶需求，提供不同測序平臺服務(wù)。

產(chǎn)品應(yīng)用

醫(yī)學(xué)上的應(yīng)用方向——

農(nóng)學(xué)上的應(yīng)用方向 ——

研究內(nèi)容

標(biāo)準(zhǔn)信息分析：

1. 基本數(shù)據(jù)統(tǒng)計① 去除接頭序列、低質(zhì)量序列得到reads信息，② 樣品相關(guān)性，③ 表達(dá)量分布，④ RNA分類；

2. 參考基因組比對；

3. mRNA鑒定；

4. mRNA定量分析；

5. mRNA差異表達(dá)分析（樣本間、組間）；

6. mRNA表達(dá)/差異基因聚類；

7. mRNA差異基因GO分類、富集；

8. mRNA差異基因KEGG分類、富集。

Dr.Tom信息分析：

一）數(shù)據(jù)庫注釋

1. 轉(zhuǎn)錄因子注釋（AnimalTFDB/PlantTFDB）；

2. GSEA分析；

3. Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro數(shù)據(jù)庫注釋；

二）互作網(wǎng)絡(luò)分析

1. 靶基因分析① miRNA-mRNA靶向關(guān)系分析，② lncRNA-mRNA靶向關(guān)系分析；

2. ceRNA互作網(wǎng)絡(luò)分析；

3. 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析；

4. 共表達(dá)互作網(wǎng)絡(luò)分析；

三）特色分析

1. 自定義標(biāo)簽和自有數(shù)據(jù)上傳；

2. 外部數(shù)據(jù)庫信息（TCGA、ARCHS4）；

3. 關(guān)鍵驅(qū)動基因網(wǎng)絡(luò)圖分析；

4. 時間序列分析。

（*以上分析內(nèi)容為部分物種可做。）

定制化信息分析：

1. 可結(jié)合客戶的需求，協(xié)商確定定制化信息分析內(nèi)容。