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長(zhǎng)鏈非編碼 RNA 測(cè)序
LncRNA高通量測(cè)序,采用去核糖體鏈特異性建庫(kù)方法,對(duì)長(zhǎng)鏈非編碼 RNA、mRNA 、環(huán)狀RNA等大RNA進(jìn)行測(cè)序研究。
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最后更新:2022-10-14半年訪問(wèn):6
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  LncRNA高通量測(cè)序,采用去核糖體鏈特異性建庫(kù)方法,對(duì)長(zhǎng)鏈非編碼 RNA、mRNA 、環(huán)狀RNA等大RNA進(jìn)行測(cè)序研究,從而快速全面準(zhǔn)確地獲得與特定生物學(xué)過(guò)程(例如發(fā)育、疾病等)所有大RNA轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)信息,可應(yīng)用于細(xì)胞分化和發(fā)育的研究、調(diào)控機(jī)理的研究、疾病標(biāo)志物的尋找、疾病的分子診斷、基因藥物的研發(fā)等。                                                                           

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

1.  超高的技術(shù)穩(wěn)定性

同一樣本重復(fù)建庫(kù)相關(guān)性Pearson值大于0.993;

2.  豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)

已完成萬(wàn)例lncRNA項(xiàng)目,涉及人鼠及動(dòng)植物物種;

3.  精湛的技術(shù)工藝

可承接人、鼠、動(dòng)植物樣品,外泌體、FFPE等,樣品起始量低至20ng;

4.  Dr.Tom多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)交付,分析無(wú)憂

一次測(cè)序即可獲得mRNA、lncRNA、circRNA及關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)分析結(jié)果;

10大數(shù)據(jù)庫(kù)注釋,多維度結(jié)果圖片展示,數(shù)據(jù)圖表循環(huán)挖掘;

ceRNA、蛋白、共表達(dá)、關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)基因互作網(wǎng)絡(luò)分析可視化;

系統(tǒng)隨時(shí)更新文獻(xiàn)信息,查基因得文獻(xiàn),便于文章撰寫;

5.  嚴(yán)格的質(zhì)量管理

實(shí)驗(yàn)全程采用全方位質(zhì)控體系,應(yīng)用質(zhì)量管理體系金標(biāo)準(zhǔn);

6.  貼心的售后支持

7*24小時(shí)全天候技術(shù)支持,快速響應(yīng)客戶需求。

產(chǎn)品應(yīng)用

1. 細(xì)胞分化和發(fā)育調(diào)控機(jī)理的研究

2. 疾病標(biāo)志物的尋找

3. 疾病的分子診斷

4. 基因藥物的研發(fā)

信息分析內(nèi)容

標(biāo)準(zhǔn)信息分析(circRNA僅限人、小鼠)

1、基本數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

① 去除接頭序列、低質(zhì)量序列得到reads信息

② 樣品相關(guān)性

③ 表達(dá)量分布

④ RNA分類

2、參考基因組比對(duì)

3、lncRNA、mRNA、circRNA鑒定

4、lncRNA、mRNA、circRNA定量分析

5、lncRNA、mRNA、circRNA差異表達(dá)分析(樣本間、組間)

6、lncRNA、mRNA、circRNA表達(dá)/差異基因聚類

7、mRNA差異基因GO分類、富集

8、mRNA差異基因KEGG分類、富集

9、mRNA結(jié)構(gòu)分析

① 可變剪切分析

② 融合基因分析(僅限人)

高級(jí)信息分析

一)數(shù)據(jù)庫(kù)注釋

1、轉(zhuǎn)錄因子注釋(AnimalTFDB/PlantTFDB)

2、GSEA分析

3、Rfam、Pfam、Reactome、COG、EggNOG和InterPro數(shù)據(jù)庫(kù)注釋

二)互作網(wǎng)絡(luò)分析

1、  靶基因分析

① miRNA-mRNA靶向關(guān)系分析

② lncRNA-mRNA靶向關(guān)系分析

2、  ceRNA互作網(wǎng)絡(luò)分析

3、  蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析

4、  共表達(dá)互作網(wǎng)絡(luò)分析

三)特色分析

1、外部數(shù)據(jù)庫(kù)關(guān)聯(lián)分析(TCGA、ARCHS4)

2、關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)基因網(wǎng)絡(luò)圖分析

3、時(shí)間序列分析

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