這一項研究將調(diào)控機制研究延伸到“ 網(wǎng)、多層面”結(jié)合的立體模式,有助于相對全面解讀生物學(xué)現(xiàn)象。
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推薦方案
推薦兩種測序策略方案:
1) 經(jīng)濟型模式-兩種文庫測序:LncRNA-Seq + Small RNA
大RNA研究:采用LncRNA-Seq測序模式,即采用去核糖體鏈特異性建庫模式,進行PE100測序模式,10G Clean data;實現(xiàn)lncRNA、mRNA、circRNA鑒定和定量、以及功能分析;
小RNA研究:采用富集小RNA片段建庫方法,進行有方向性的SE50測序模式,20M clean reads,實現(xiàn)miRNA、siRNA以及piRNA鑒定和定量,以及功能分析等;
2) 大容量模式-三種文庫測序:LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA
大RNA研究:采用LncRNA-Seq測序模式,即采用去核糖體鏈特異性建庫模式,進行PE100測序模式,10G Clean data;實現(xiàn)lncRNA、mRNA、鑒定和定量、以及功能分析;
環(huán)狀RNA研究:采用去除線性RNA,反向富集環(huán)狀RNA建庫方法,進行PE100測序模式,10G clean data,對環(huán)狀RNA高深度測序,實現(xiàn)對低豐度的環(huán)狀RNA鑒定和定量及功能分析;
小RNA研究:采用富集小RNA片段建庫方法,進行有方向性的SE50測序模式,20M clean reads,實現(xiàn)miRNA、siRNA以及piRNA鑒定和定量,以及功能分析等;
以上兩種模式,還可以實現(xiàn)大RNA和小RNA互作網(wǎng)絡(luò)分析,以及內(nèi)源競爭性RNA鑒定和網(wǎng)絡(luò)分析。
生物分析思路圖
產(chǎn)品優(yōu)勢
實驗嚴謹
建庫工藝穩(wěn)定,技術(shù)重復(fù)性高,可接受多種類型樣本,total RNA最低起始量低至400ng;
分析全面
包含RNA互作模式,及ceRNA競爭網(wǎng)絡(luò)分析等,從平面調(diào)控研究延伸至立體調(diào)控研究;
數(shù)據(jù)交互
采用Dr.Tom多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng),10大數(shù)據(jù)庫注釋,多維度結(jié)果圖片展示,數(shù)據(jù)圖表循環(huán)挖掘;
質(zhì)控嚴格
實驗操作及信息分析操作采用全方位及先進的質(zhì)量管理體系標(biāo)準。
產(chǎn)品應(yīng)用
動植物生長發(fā)育的研究
抗逆、抗病蟲害調(diào)控機理的研究
細胞分化和發(fā)育的研究
腫瘤發(fā)生發(fā)展及轉(zhuǎn)移研究