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全轉(zhuǎn)錄組高通量測序
這一項研究將調(diào)控機制研究延伸到“ 網(wǎng)、多層面”結(jié)合的立體模式,有助于相對全面解讀生物學(xué)現(xiàn)象。
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最后更新:2022-10-14半年訪問:7
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全轉(zhuǎn)錄組高通量測序,采用去核糖體鏈特異性建庫方法和小片段富集篩選建庫方法,可實現(xiàn)編碼RNA和非編碼RNA的建庫、測序、信息分析及聯(lián)合分析、ceRNA等,從而快速全面準確地獲得與特定生物學(xué)過程(例如發(fā)育、疾病等)所有大RNA轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)信息,這一項研究將調(diào)控機制研究延伸到“ 網(wǎng)、多層面”結(jié)合的立體模式,有助于相對全面解讀生物學(xué)現(xiàn)象。

推薦方案

推薦兩種測序策略方案:

1) 經(jīng)濟型模式-兩種文庫測序:LncRNA-Seq + Small RNA

大RNA研究:采用LncRNA-Seq測序模式,即采用去核糖體鏈特異性建庫模式,進行PE100測序模式,10G Clean data;實現(xiàn)lncRNA、mRNA、circRNA鑒定和定量、以及功能分析;

小RNA研究:采用富集小RNA片段建庫方法,進行有方向性的SE50測序模式,20M clean reads,實現(xiàn)miRNA、siRNA以及piRNA鑒定和定量,以及功能分析等;

2) 大容量模式-三種文庫測序:LncRNA-Seq+ Small RNA+ CircRNA

大RNA研究:采用LncRNA-Seq測序模式,即采用去核糖體鏈特異性建庫模式,進行PE100測序模式,10G Clean data;實現(xiàn)lncRNA、mRNA、鑒定和定量、以及功能分析;

環(huán)狀RNA研究:采用去除線性RNA,反向富集環(huán)狀RNA建庫方法,進行PE100測序模式,10G clean data,對環(huán)狀RNA高深度測序,實現(xiàn)對低豐度的環(huán)狀RNA鑒定和定量及功能分析;

小RNA研究:采用富集小RNA片段建庫方法,進行有方向性的SE50測序模式,20M clean reads,實現(xiàn)miRNA、siRNA以及piRNA鑒定和定量,以及功能分析等; 

以上兩種模式,還可以實現(xiàn)大RNA和小RNA互作網(wǎng)絡(luò)分析,以及內(nèi)源競爭性RNA鑒定和網(wǎng)絡(luò)分析。

 

生物分析思路圖全轉(zhuǎn)錄組流程圖

 

產(chǎn)品優(yōu)勢

實驗嚴謹

建庫工藝穩(wěn)定,技術(shù)重復(fù)性高,可接受多種類型樣本,total RNA最低起始量低至400ng;

分析全面

包含RNA互作模式,及ceRNA競爭網(wǎng)絡(luò)分析等,從平面調(diào)控研究延伸至立體調(diào)控研究;

數(shù)據(jù)交互

采用Dr.Tom多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng),10大數(shù)據(jù)庫注釋,多維度結(jié)果圖片展示,數(shù)據(jù)圖表循環(huán)挖掘;

質(zhì)控嚴格

實驗操作及信息分析操作采用全方位及先進的質(zhì)量管理體系標(biāo)準。

產(chǎn)品應(yīng)用

動植物生長發(fā)育的研究

抗逆、抗病蟲害調(diào)控機理的研究

細胞分化和發(fā)育的研究

腫瘤發(fā)生發(fā)展及轉(zhuǎn)移研究

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