測序平臺454、Ion、illumina
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新一代高通量測序技術(shù)大大減少了基因組測序的成本和時間,近年來新上市的Ion系列桌面測序儀,以其低廉的價格和搞笑的測序速度,讓測序儀可以很容易的走進(jìn)實驗室,讓需求越來越多的實驗室可以獨立開展微生物基因組測序項目。
硬件需求
微生物的基因組較小,因此微生物基因組拼接對內(nèi)存資源消耗也小,不需要真核生物基因組幾百G的內(nèi)存需求。
推薦產(chǎn)品
SeqKit
SeqStation
解決方案概要
基因組組裝 | Newbler、MIRA、Velvet、SOAPDenovo |
基因預(yù)測 | Glimmer、FgenesB、Genemark、Blast |
基因功能注釋 | Blast2GO、InterProScan、RPS-BLAST、SingnalP、TMHMM、KASS/KEGG |